More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3363 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.95 
 
 		 1029 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  52.38 
 
 		 1013 aa  913    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  66.94 
 
 		 1028 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 		 1007 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  40.02 
 
 		 1072 aa  680    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 		 1112 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 1047 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  36.49 
 
 		 1047 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  85.89 
 
 		 1074 aa  1699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 1048 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  39.41 
 
 		 1078 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  43.71 
 
 		 1006 aa  666    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  49.95 
 
 		 1040 aa  858    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1050 aa  2032    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  40.09 
 
 		 1019 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  46.26 
 
 		 1033 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  45.25 
 
 		 1007 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  51.83 
 
 		 990 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  50.26 
 
 		 1019 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  39.33 
 
 		 1065 aa  592  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  40.09 
 
 		 1063 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  48.37 
 
 		 958 aa  578  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.84 
 
 		 1099 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.66 
 
 		 1067 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  47.7 
 
 		 988 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.99 
 
 		 933 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  34.41 
 
 		 1048 aa  567  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 		 925 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  45.86 
 
 		 924 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  38.85 
 
 		 886 aa  558  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  43.19 
 
 		 980 aa  552  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  40.75 
 
 		 918 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  40.47 
 
 		 918 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  42.2 
 
 		 918 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  42.35 
 
 		 918 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  42.2 
 
 		 918 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 		 918 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  42.35 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  42.2 
 
 		 918 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  42.05 
 
 		 918 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  42.2 
 
 		 918 aa  539  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  57.17 
 
 		 1026 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 		 918 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  40.53 
 
 		 1175 aa  518  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  41.74 
 
 		 1185 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  45.56 
 
 		 901 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  44.14 
 
 		 917 aa  496  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 		 898 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  53.88 
 
 		 621 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  48.51 
 
 		 1531 aa  475  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  44.25 
 
 		 892 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  38.23 
 
 		 1152 aa  465  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  40 
 
 		 1194 aa  459  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  45.13 
 
 		 903 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  41.43 
 
 		 902 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  44.54 
 
 		 899 aa  456  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  41.81 
 
 		 949 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 		 895 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  44.73 
 
 		 931 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5983  SNF2-related protein  34.47 
 
 		 1139 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42 
 
 		 1082 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  46.51 
 
 		 617 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.26 
 
 		 1087 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.81 
 
 		 982 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.39 
 
 		 1077 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 1112 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 		 1021 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  37.89 
 
 		 964 aa  360  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 		 1055 aa  357  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  43.83 
 
 		 1062 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.39 
 
 		 977 aa  351  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.22 
 
 		 1125 aa  350  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  45.45 
 
 		 1113 aa  349  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 1113 aa  349  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.12 
 
 		 1091 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 		 1069 aa  344  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.18 
 
 		 1068 aa  343  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 		 1261 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 		 1069 aa  341  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  36.75 
 
 		 1127 aa  340  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.31 
 
 		 1071 aa  340  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.9 
 
 		 1250 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.98 
 
 		 1112 aa  338  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.3 
 
 		 1178 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.7 
 
 		 1102 aa  338  3.9999999999999995e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  38.11 
 
 		 1003 aa  337  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  46.21 
 
 		 1209 aa  336  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.14 
 
 		 1068 aa  335  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 		 1129 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 		 1449 aa  335  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.31 
 
 		 1086 aa  335  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  40.35 
 
 		 1080 aa  334  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  43.16 
 
 		 1068 aa  333  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.38 
 
 		 1082 aa  332  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  43.4 
 
 		 773 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 		 1066 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 		 1139 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  38.66 
 
 		 1031 aa  330  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  37.87 
 
 		 1084 aa  330  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  43.4 
 
 		 663 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>