More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5983 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5983  SNF2-related protein  100 
 
 		 1139 aa  2187    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  31.94 
 
 		 1007 aa  515  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  32.6 
 
 		 1006 aa  513  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 1007 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.95 
 
 		 1078 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 1048 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 1112 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.22 
 
 		 1072 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  27.47 
 
 		 1047 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  37.74 
 
 		 1019 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 1047 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 1050 aa  426  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 1074 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  32.34 
 
 		 1013 aa  416  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  33.83 
 
 		 990 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  33.82 
 
 		 1040 aa  406  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 1028 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  36.53 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  29.42 
 
 		 886 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 		 925 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  33.52 
 
 		 924 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  29.54 
 
 		 1048 aa  353  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.38 
 
 		 933 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  31.36 
 
 		 918 aa  349  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  31.36 
 
 		 918 aa  349  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  31.36 
 
 		 918 aa  349  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  31.36 
 
 		 918 aa  348  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  31.26 
 
 		 918 aa  348  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  31.36 
 
 		 918 aa  347  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  31.07 
 
 		 918 aa  347  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  31.21 
 
 		 918 aa  347  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  31.11 
 
 		 918 aa  346  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 918 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 1029 aa  345  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  31.75 
 
 		 1185 aa  346  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.98 
 
 		 1067 aa  343  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 918 aa  336  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.22 
 
 		 1026 aa  333  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  36.22 
 
 		 958 aa  331  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  32.57 
 
 		 1065 aa  328  3e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.07 
 
 		 1175 aa  327  7e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  35.66 
 
 		 1033 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.23 
 
 		 1099 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  33.11 
 
 		 1063 aa  322  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  30.22 
 
 		 980 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 898 aa  314  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  33.89 
 
 		 988 aa  313  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  34.18 
 
 		 917 aa  312  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  35.42 
 
 		 1531 aa  307  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  38.26 
 
 		 621 aa  305  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  33.72 
 
 		 901 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  31.99 
 
 		 902 aa  296  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 1152 aa  286  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  32.46 
 
 		 949 aa  283  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  33.19 
 
 		 899 aa  277  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  37.43 
 
 		 617 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 895 aa  273  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  32.73 
 
 		 903 aa  271  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 		 892 aa  269  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 		 931 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  26.69 
 
 		 1194 aa  264  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 982 aa  264  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  29.01 
 
 		 964 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 1261 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  37.63 
 
 		 1209 aa  243  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  31.01 
 
 		 1127 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30 
 
 		 977 aa  238  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  29.21 
 
 		 1003 aa  237  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  33.67 
 
 		 1161 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  33.73 
 
 		 1178 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.89 
 
 		 1068 aa  234  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 1021 aa  234  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 1108 aa  232  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.5 
 
 		 1068 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 1069 aa  231  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  29.36 
 
 		 1130 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  32.45 
 
 		 1086 aa  230  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 1055 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.59 
 
 		 1071 aa  227  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  35.84 
 
 		 985 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 		 1091 aa  226  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.91 
 
 		 1134 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  37.63 
 
 		 872 aa  226  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 1129 aa  225  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.46 
 
 		 1110 aa  223  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  33.88 
 
 		 1284 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  37.47 
 
 		 773 aa  221  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 		 1110 aa  221  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.43 
 
 		 1080 aa  221  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 		 1120 aa  220  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  32.78 
 
 		 1062 aa  220  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 876 aa  219  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.38 
 
 		 1087 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  32.97 
 
 		 1163 aa  218  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.69 
 
 		 666 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 1105 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 1090 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  32.25 
 
 		 1154 aa  216  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  36.97 
 
 		 663 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  30.33 
 
 		 1354 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>