More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00501 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 
1047 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  100 
 
 
1067 aa  2159    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 
1048 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
1112 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  41.05 
 
 
1072 aa  766    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40.42 
 
 
1078 aa  767    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  65.35 
 
 
1063 aa  1441    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  65.51 
 
 
1065 aa  1449    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  42.15 
 
 
1019 aa  785    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  40.46 
 
 
1047 aa  740    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  67.23 
 
 
1099 aa  1473    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  38.13 
 
 
1006 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 
1007 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  41.58 
 
 
1019 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
1050 aa  555  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  37.88 
 
 
1007 aa  552  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 
1074 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  40.43 
 
 
990 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  35.15 
 
 
1013 aa  536  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  34.09 
 
 
1033 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  36.11 
 
 
1040 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
925 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  49.32 
 
 
1531 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
1028 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.65 
 
 
933 aa  486  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  38.72 
 
 
924 aa  479  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  33.73 
 
 
1048 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  37.05 
 
 
980 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  38.71 
 
 
1185 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
1029 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  40.91 
 
 
1175 aa  451  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  39.55 
 
 
988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  38.58 
 
 
918 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.61 
 
 
918 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.61 
 
 
918 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 
918 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.45 
 
 
918 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  38.82 
 
 
918 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.45 
 
 
918 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.45 
 
 
918 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  37.14 
 
 
886 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  38.82 
 
 
918 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.15 
 
 
918 aa  439  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.15 
 
 
918 aa  439  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.9 
 
 
1026 aa  439  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  37.3 
 
 
958 aa  435  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 
892 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  38.62 
 
 
898 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  38.83 
 
 
902 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
1152 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  35.53 
 
 
949 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  45.1 
 
 
621 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  40.83 
 
 
899 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  39.43 
 
 
917 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  35.92 
 
 
1194 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
931 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  35.44 
 
 
903 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  37.78 
 
 
901 aa  393  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
895 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.54 
 
 
977 aa  362  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  40.25 
 
 
617 aa  354  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  42.02 
 
 
1055 aa  353  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.9 
 
 
1087 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 
982 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
1403 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  40.57 
 
 
1021 aa  345  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
1082 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  43.34 
 
 
872 aa  339  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.04 
 
 
914 aa  338  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  39.85 
 
 
918 aa  337  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 
1108 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
1104 aa  335  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  38.87 
 
 
1362 aa  334  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.57 
 
 
1068 aa  333  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
1112 aa  333  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  39.63 
 
 
1386 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 
1068 aa  332  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
1139 aa  331  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.42 
 
 
1071 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  39.68 
 
 
1003 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 
876 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  37.97 
 
 
1178 aa  328  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.21 
 
 
964 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  40.9 
 
 
1082 aa  327  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 
1069 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  41 
 
 
1068 aa  327  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.4 
 
 
1068 aa  327  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 
1105 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  41.43 
 
 
666 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.96 
 
 
1088 aa  326  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  39.61 
 
 
1112 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.6 
 
 
1070 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  41.37 
 
 
663 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  41.05 
 
 
1073 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  39.47 
 
 
1125 aa  325  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
1129 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  40.7 
 
 
1082 aa  325  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
1105 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.29 
 
 
1070 aa  324  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.75 
 
 
1088 aa  324  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>