More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0006 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  100 
 
 		 1194 aa  2444    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  34.96 
 
 		 1185 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  34.01 
 
 		 1175 aa  632  1e-179  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 1152 aa  600  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40.72 
 
 		 918 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.56 
 
 		 918 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  40.72 
 
 		 918 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.72 
 
 		 918 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.72 
 
 		 918 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.72 
 
 		 918 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.72 
 
 		 918 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  40.56 
 
 		 918 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  40.56 
 
 		 918 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.41 
 
 		 918 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  40.09 
 
 		 1006 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  39.69 
 
 		 1050 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 		 918 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.03 
 
 		 1028 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.59 
 
 		 1048 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  41.46 
 
 		 1040 aa  446  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 		 933 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  38.35 
 
 		 1078 aa  443  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  40.03 
 
 		 1074 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  38.28 
 
 		 1072 aa  439  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  38.44 
 
 		 990 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.47 
 
 		 1007 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  39.49 
 
 		 1007 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  37.83 
 
 		 1048 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 		 925 aa  433  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  39.14 
 
 		 924 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  36.15 
 
 		 988 aa  429  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  37.92 
 
 		 1013 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  36.59 
 
 		 958 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 1112 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  35.81 
 
 		 1047 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 1047 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  37.58 
 
 		 1019 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  35.96 
 
 		 1033 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 1029 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  33.38 
 
 		 980 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  35.1 
 
 		 1065 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  36.91 
 
 		 886 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 		 892 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.92 
 
 		 1067 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  36.34 
 
 		 903 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  37.97 
 
 		 949 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  34.3 
 
 		 1063 aa  393  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  35.43 
 
 		 1019 aa  392  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 		 895 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  37.44 
 
 		 902 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 		 898 aa  390  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  38.59 
 
 		 899 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  42.5 
 
 		 621 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  36.02 
 
 		 901 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.27 
 
 		 1099 aa  383  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  34.57 
 
 		 917 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  41.85 
 
 		 1531 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.53 
 
 		 1026 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  43.51 
 
 		 1087 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 		 931 aa  363  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 		 1112 aa  361  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.44 
 
 		 1077 aa  352  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  36.06 
 
 		 1250 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 		 1261 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 		 617 aa  346  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.01 
 
 		 1139 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 777 aa  344  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  41.75 
 
 		 1071 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  38.89 
 
 		 773 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  42.08 
 
 		 1130 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.36 
 
 		 1082 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  37.9 
 
 		 1086 aa  338  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  40.46 
 
 		 663 aa  338  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 		 1069 aa  337  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  39.8 
 
 		 1031 aa  335  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.67 
 
 		 1091 aa  335  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.85 
 
 		 1068 aa  335  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 		 1055 aa  334  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40.25 
 
 		 1125 aa  333  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  39.79 
 
 		 1108 aa  332  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 		 1129 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 1104 aa  331  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 		 1073 aa  330  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.37 
 
 		 1073 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 1021 aa  329  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  36.42 
 
 		 1082 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.18 
 
 		 1082 aa  328  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  39.25 
 
 		 918 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  41.33 
 
 		 1070 aa  328  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  40.12 
 
 		 1127 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.25 
 
 		 914 aa  328  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  36.42 
 
 		 1082 aa  328  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 		 1073 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 		 1073 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 		 982 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.65 
 
 		 1091 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 1113 aa  327  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40 
 
 		 1113 aa  327  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 		 1073 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 		 1155 aa  327  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>