More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1215 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 		 1029 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  50.97 
 
 		 988 aa  873    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  100 
 
 		 958 aa  1873    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  48.43 
 
 		 1074 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  51.01 
 
 		 1050 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  39.46 
 
 		 1013 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.71 
 
 		 1026 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  42.55 
 
 		 1040 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  42.22 
 
 		 990 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  47.28 
 
 		 1033 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  45.11 
 
 		 1078 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  58.39 
 
 		 1028 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  43.55 
 
 		 1006 aa  530  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  44.3 
 
 		 1007 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  43.69 
 
 		 1072 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.63 
 
 		 1112 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 		 1007 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 		 925 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  43.94 
 
 		 924 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 		 1048 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.37 
 
 		 933 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  32.97 
 
 		 1175 aa  508  9.999999999999999e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  45.67 
 
 		 1019 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 		 918 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.61 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.61 
 
 		 918 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.61 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.61 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.61 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.37 
 
 		 918 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.61 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  40.18 
 
 		 1019 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.1 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  42.03 
 
 		 1047 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 918 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  38.88 
 
 		 918 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 		 1047 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  41.11 
 
 		 980 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  41.76 
 
 		 1048 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  39.44 
 
 		 1185 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  40.32 
 
 		 886 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 1152 aa  460  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  44.3 
 
 		 903 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  40.23 
 
 		 1065 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  46.61 
 
 		 1531 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.45 
 
 		 1067 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 898 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  41.63 
 
 		 1063 aa  442  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.4 
 
 		 1099 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  45.04 
 
 		 949 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  50 
 
 		 621 aa  436  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  43.54 
 
 		 917 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  43.48 
 
 		 901 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  36.74 
 
 		 1194 aa  432  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  42.28 
 
 		 892 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  39.82 
 
 		 902 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  39.74 
 
 		 899 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 		 931 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.77 
 
 		 895 aa  384  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.12 
 
 		 1112 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  41.74 
 
 		 1077 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 		 617 aa  359  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.63 
 
 		 1087 aa  357  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.29 
 
 		 1082 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  45.77 
 
 		 1209 aa  349  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.42 
 
 		 1068 aa  348  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 982 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  43.1 
 
 		 663 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  42.48 
 
 		 1086 aa  342  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  41.36 
 
 		 1163 aa  341  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 		 1069 aa  340  7e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.67 
 
 		 1082 aa  340  7e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  39.25 
 
 		 1125 aa  339  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.68 
 
 		 1062 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  41.11 
 
 		 1080 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.88 
 
 		 773 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 1110 aa  337  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.07 
 
 		 1071 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.6 
 
 		 1178 aa  334  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.83 
 
 		 1068 aa  333  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1354 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.89 
 
 		 1100 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.13 
 
 		 1104 aa  332  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 1403 aa  330  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.84 
 
 		 1102 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.6 
 
 		 1003 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.46 
 
 		 777 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.87 
 
 		 977 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 		 1068 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  40.89 
 
 		 1025 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 1068 aa  325  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  38.48 
 
 		 1088 aa  325  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.61 
 
 		 1386 aa  325  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.81 
 
 		 1150 aa  325  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 		 1091 aa  324  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  39.88 
 
 		 1021 aa  324  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1112 aa  324  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1088 aa  323  7e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  42.23 
 
 		 985 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  41.47 
 
 		 1357 aa  323  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>