More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0505 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 617 aa  1244    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  50.73 
 
 		 621 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  44.46 
 
 		 1078 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  43.45 
 
 		 1072 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  50.63 
 
 		 1019 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  47.02 
 
 		 1006 aa  422  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.05 
 
 		 1112 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  44.56 
 
 		 918 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.22 
 
 		 1048 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  48.21 
 
 		 1047 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.21 
 
 		 1047 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  44.35 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  44.35 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 		 1028 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  44.35 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  44.35 
 
 		 918 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  44.54 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  44.54 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  44.54 
 
 		 918 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  44.35 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  44.54 
 
 		 918 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  40.37 
 
 		 1531 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  44.8 
 
 		 1007 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.13 
 
 		 925 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  48.63 
 
 		 1040 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  46.51 
 
 		 1074 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.68 
 
 		 1007 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  44.07 
 
 		 1185 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  41.19 
 
 		 1175 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  46.27 
 
 		 1013 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  44.28 
 
 		 924 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  45.07 
 
 		 988 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  41.32 
 
 		 1019 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  46.07 
 
 		 990 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  40.8 
 
 		 980 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 		 933 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 		 1152 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  43.24 
 
 		 901 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 		 1029 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  42.24 
 
 		 917 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  45.29 
 
 		 1033 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.03 
 
 		 1026 aa  360  6e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  45.03 
 
 		 903 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  41.63 
 
 		 898 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  41.81 
 
 		 1065 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.25 
 
 		 1067 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  40.84 
 
 		 1048 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  42.68 
 
 		 958 aa  352  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  41.77 
 
 		 902 aa  349  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 		 892 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  43.21 
 
 		 899 aa  347  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  40.22 
 
 		 1194 aa  346  7e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  40.76 
 
 		 886 aa  345  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 		 931 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  42.46 
 
 		 1063 aa  342  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.02 
 
 		 1087 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 1112 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.67 
 
 		 1099 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  41.88 
 
 		 949 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.84 
 
 		 1071 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  46.28 
 
 		 985 aa  331  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 		 895 aa  329  8e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 		 1069 aa  329  8e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.23 
 
 		 1125 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 		 1091 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.25 
 
 		 1068 aa  326  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.71 
 
 		 1068 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  40.21 
 
 		 1362 aa  320  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  39.57 
 
 		 1386 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  40.28 
 
 		 1121 aa  316  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.77 
 
 		 1104 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  39.41 
 
 		 1178 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 		 1082 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 1068 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 982 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.43 
 
 		 959 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  41.87 
 
 		 1449 aa  309  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 		 1021 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.05 
 
 		 977 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1086 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.93 
 
 		 1250 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 		 1068 aa  307  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  38.49 
 
 		 1181 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1088 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  35.94 
 
 		 1069 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  35.94 
 
 		 1069 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.45 
 
 		 1077 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.16 
 
 		 1082 aa  304  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.34 
 
 		 1261 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.36 
 
 		 777 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.87 
 
 		 1129 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.96 
 
 		 1088 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  37.83 
 
 		 1112 aa  302  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 		 1073 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  41.39 
 
 		 1120 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 		 1069 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 		 1139 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  36.84 
 
 		 1031 aa  300  4e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>