More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1235 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  43 
 
 
1074 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 
1048 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  43.14 
 
 
1013 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  41.89 
 
 
1040 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  45.25 
 
 
1050 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40.12 
 
 
1078 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  73.09 
 
 
1006 aa  1511    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  43.92 
 
 
990 aa  672    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  41 
 
 
1112 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  63.49 
 
 
1007 aa  1302    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  100 
 
 
1007 aa  2066    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  38.27 
 
 
1072 aa  632  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
1047 aa  619  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  37.59 
 
 
1047 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  40.11 
 
 
1019 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  40.73 
 
 
1019 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  40.38 
 
 
1033 aa  582  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  39.7 
 
 
1065 aa  578  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
1029 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.88 
 
 
1067 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.46 
 
 
925 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  41.27 
 
 
924 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  54.49 
 
 
1028 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  39.14 
 
 
1063 aa  555  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  37.98 
 
 
886 aa  555  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 
933 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  36.41 
 
 
1048 aa  545  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.06 
 
 
1099 aa  539  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.82 
 
 
918 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  38.31 
 
 
918 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.95 
 
 
918 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  39.95 
 
 
918 aa  535  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.77 
 
 
918 aa  532  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.35 
 
 
918 aa  532  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
918 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  40.08 
 
 
980 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.69 
 
 
918 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.69 
 
 
918 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.69 
 
 
918 aa  532  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.69 
 
 
918 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  44.3 
 
 
958 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  41.07 
 
 
1175 aa  512  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.05 
 
 
1026 aa  509  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  41.38 
 
 
1185 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  41.38 
 
 
988 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5983  SNF2-related protein  31.74 
 
 
1139 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  42.33 
 
 
917 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  47.77 
 
 
621 aa  483  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  47.41 
 
 
1531 aa  482  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
898 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 
1152 aa  479  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  42.6 
 
 
902 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  41.31 
 
 
949 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  41.7 
 
 
901 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  42.41 
 
 
899 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  39.43 
 
 
1194 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  41.93 
 
 
892 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
931 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 
895 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  37.22 
 
 
903 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
617 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.78 
 
 
1087 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
982 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.59 
 
 
1071 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 
1069 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.51 
 
 
1068 aa  370  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
1068 aa  370  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 
1021 aa  366  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.41 
 
 
1068 aa  363  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.46 
 
 
977 aa  363  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.26 
 
 
1077 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.84 
 
 
1086 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  40.9 
 
 
1080 aa  360  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.75 
 
 
1112 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
1091 aa  357  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
1082 aa  356  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 
1055 aa  356  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.11 
 
 
964 aa  356  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41 
 
 
1178 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  34.62 
 
 
1003 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  41.7 
 
 
1031 aa  355  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.43 
 
 
1209 aa  351  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.17 
 
 
1134 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.97 
 
 
1062 aa  349  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40.21 
 
 
1125 aa  347  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  40.33 
 
 
1082 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  39.71 
 
 
1082 aa  344  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.76 
 
 
1070 aa  344  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  39.71 
 
 
1082 aa  344  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
1104 aa  343  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.11 
 
 
1112 aa  343  8e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.27 
 
 
1113 aa  343  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 
1113 aa  343  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
1073 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.5 
 
 
1070 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
1073 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  39.63 
 
 
1073 aa  340  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
1073 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  41.98 
 
 
918 aa  336  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  40.79 
 
 
1357 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>