More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  100 
 
 		 1026 aa  2028    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 		 1029 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  44.84 
 
 		 958 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  43.15 
 
 		 988 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  45.47 
 
 		 1013 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  45.96 
 
 		 990 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  57.38 
 
 		 1050 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  57.17 
 
 		 1074 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 		 1007 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  55.47 
 
 		 1028 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  46.09 
 
 		 1040 aa  519  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  42.05 
 
 		 1006 aa  511  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  44.01 
 
 		 1033 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  41.91 
 
 		 1007 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  37.95 
 
 		 1078 aa  499  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 		 1112 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  38.55 
 
 		 1072 aa  495  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 		 1048 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 925 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  38.86 
 
 		 924 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.4 
 
 		 1047 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  39.4 
 
 		 1047 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  40.81 
 
 		 1019 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  37.64 
 
 		 886 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  37.43 
 
 		 918 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  37.15 
 
 		 918 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  37.15 
 
 		 918 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  37.15 
 
 		 918 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  37.43 
 
 		 918 aa  459  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  49.15 
 
 		 1019 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  37.01 
 
 		 918 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  37.01 
 
 		 918 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.9 
 
 		 1067 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  40.28 
 
 		 1065 aa  452  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  37.15 
 
 		 918 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  43.5 
 
 		 1175 aa  444  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  37.43 
 
 		 1048 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  36.58 
 
 		 918 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  36.51 
 
 		 918 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  36.44 
 
 		 918 aa  439  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  50.72 
 
 		 621 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  40.03 
 
 		 1063 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.47 
 
 		 1099 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 		 933 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  45.73 
 
 		 1185 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  39.16 
 
 		 898 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  39.66 
 
 		 901 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  44.84 
 
 		 1531 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  38.1 
 
 		 917 aa  419  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 		 1152 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  38.03 
 
 		 902 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  40.85 
 
 		 931 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  39.22 
 
 		 949 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  42.57 
 
 		 980 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  38.76 
 
 		 899 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  39.3 
 
 		 903 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 		 895 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 		 892 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  40.53 
 
 		 1194 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  43.03 
 
 		 617 aa  360  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.19 
 
 		 1087 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 1112 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.72 
 
 		 1082 aa  343  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.35 
 
 		 1077 aa  338  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 982 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.77 
 
 		 1068 aa  333  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.61 
 
 		 1125 aa  332  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.95 
 
 		 1209 aa  330  9e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.65 
 
 		 1071 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.77 
 
 		 1068 aa  328  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  37.95 
 
 		 1084 aa  327  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.06 
 
 		 1178 aa  326  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  42.07 
 
 		 1062 aa  325  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 		 1091 aa  324  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.95 
 
 		 977 aa  324  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.85 
 
 		 1403 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  40.68 
 
 		 1362 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 		 1055 aa  323  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  41.1 
 
 		 1386 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  37.75 
 
 		 1084 aa  323  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.85 
 
 		 1069 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  39.13 
 
 		 1031 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  41.09 
 
 		 1082 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.66 
 
 		 773 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.47 
 
 		 914 aa  320  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  41.09 
 
 		 1082 aa  320  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  43.12 
 
 		 663 aa  320  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.6 
 
 		 918 aa  319  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.85 
 
 		 1086 aa  319  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 		 1068 aa  318  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40 
 
 		 1102 aa  318  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.67 
 
 		 1082 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  40.04 
 
 		 1070 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 1139 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.68 
 
 		 777 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  39.58 
 
 		 1134 aa  313  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  37.3 
 
 		 1161 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.76 
 
 		 1150 aa  313  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.5 
 
 		 1088 aa  313  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.05 
 
 		 1129 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>