More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12135 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  40 
 
 
1072 aa  662    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  52.19 
 
 
1050 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  37.5 
 
 
1047 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
1048 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.2 
 
 
1029 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  51.46 
 
 
990 aa  847    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  47.85 
 
 
1040 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  46.75 
 
 
1019 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.81 
 
 
1028 aa  829    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40.1 
 
 
1078 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  43.41 
 
 
1006 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
1112 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
1007 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  49.77 
 
 
1074 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 
1047 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  45.38 
 
 
1033 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  43.14 
 
 
1007 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  100 
 
 
1013 aa  2027    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  38.64 
 
 
1019 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  38.07 
 
 
1048 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  45.11 
 
 
924 aa  589  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  39.6 
 
 
886 aa  581  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  47.97 
 
 
958 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.61 
 
 
925 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.59 
 
 
933 aa  579  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  47.15 
 
 
988 aa  572  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  45.44 
 
 
980 aa  559  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.33 
 
 
1067 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  41.61 
 
 
918 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  41.35 
 
 
918 aa  552  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  41.35 
 
 
918 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  41.35 
 
 
918 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  41.35 
 
 
918 aa  552  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  41.48 
 
 
918 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  41.35 
 
 
918 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  41.22 
 
 
918 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 
918 aa  545  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  41.22 
 
 
918 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  45.76 
 
 
1026 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  37.69 
 
 
1065 aa  536  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  42.14 
 
 
918 aa  529  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  36.3 
 
 
1063 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.86 
 
 
1099 aa  522  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  34.53 
 
 
1175 aa  503  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  45.25 
 
 
898 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  45.96 
 
 
901 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  45.09 
 
 
917 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  41.62 
 
 
1185 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  43.17 
 
 
902 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  43.05 
 
 
903 aa  485  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  44.44 
 
 
899 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  44.34 
 
 
892 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  51.62 
 
 
621 aa  469  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  49.24 
 
 
1531 aa  465  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  40.99 
 
 
949 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 
1152 aa  450  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 
931 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  37.97 
 
 
1194 aa  436  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 
895 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
617 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5983  SNF2-related protein  31.87 
 
 
1139 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 
982 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.17 
 
 
1087 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
1069 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  38.74 
 
 
1077 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
1082 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 
1021 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  41.51 
 
 
1068 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  43.85 
 
 
1062 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  43.21 
 
 
1178 aa  365  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.87 
 
 
1091 aa  365  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  44.08 
 
 
1055 aa  364  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  41.09 
 
 
1068 aa  363  9e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  46.17 
 
 
1102 aa  363  9e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  41.36 
 
 
1080 aa  363  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  45.97 
 
 
1108 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.46 
 
 
977 aa  362  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.41 
 
 
1112 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  41.5 
 
 
1071 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.93 
 
 
1125 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  43.23 
 
 
1112 aa  358  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  44.74 
 
 
918 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.33 
 
 
914 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  42 
 
 
1073 aa  354  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.2 
 
 
1113 aa  353  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  46.2 
 
 
1113 aa  353  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.39 
 
 
1129 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  45.66 
 
 
663 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  41.34 
 
 
1127 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  42.92 
 
 
1082 aa  353  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.74 
 
 
1073 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  45.45 
 
 
773 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  42 
 
 
1073 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  42 
 
 
1073 aa  351  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
1073 aa  350  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.64 
 
 
1082 aa  350  8e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  45.11 
 
 
991 aa  350  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  42.22 
 
 
1082 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  42.22 
 
 
1082 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  42.07 
 
 
1070 aa  347  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>