More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02510 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  100 
 
 
939 aa  1942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  36.46 
 
 
1107 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  37.1 
 
 
1093 aa  485  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  34.58 
 
 
1222 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  36.07 
 
 
609 aa  294  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  36.57 
 
 
1096 aa  294  6e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.22 
 
 
1566 aa  293  7e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  35.47 
 
 
589 aa  291  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.9 
 
 
1407 aa  290  9e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  35.13 
 
 
509 aa  290  9e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  35.15 
 
 
1111 aa  290  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  33.45 
 
 
1443 aa  288  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  35.55 
 
 
995 aa  286  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  32.94 
 
 
1259 aa  286  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  34.36 
 
 
1431 aa  285  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  33.33 
 
 
1023 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  33.76 
 
 
956 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  34.85 
 
 
1558 aa  280  7e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  34.61 
 
 
970 aa  279  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  33.83 
 
 
522 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  32.76 
 
 
868 aa  273  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  34.22 
 
 
860 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  32.6 
 
 
1519 aa  266  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  32.76 
 
 
1517 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  31.92 
 
 
1414 aa  259  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  31.95 
 
 
926 aa  258  5e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  32.48 
 
 
663 aa  250  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
1112 aa  243  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
1069 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  30.67 
 
 
495 aa  236  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.63 
 
 
1071 aa  232  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  29.52 
 
 
1326 aa  231  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  33.87 
 
 
1082 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
1091 aa  231  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  33.69 
 
 
1082 aa  231  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  31.42 
 
 
479 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  33.69 
 
 
1082 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
982 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
1068 aa  228  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  31.86 
 
 
1064 aa  227  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.07 
 
 
1134 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  32.78 
 
 
1064 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.52 
 
 
663 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.33 
 
 
773 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  30.09 
 
 
1003 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  32.78 
 
 
1064 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  32.78 
 
 
1064 aa  225  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  32.78 
 
 
1064 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  32.78 
 
 
1064 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  31.86 
 
 
1064 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  32.6 
 
 
1064 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  31.67 
 
 
1068 aa  224  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.09 
 
 
1070 aa  223  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  30.04 
 
 
1125 aa  224  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  32.6 
 
 
1064 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
1068 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  29.82 
 
 
1193 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  31.16 
 
 
1068 aa  222  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 
1073 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.09 
 
 
1848 aa  220  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
848 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
1073 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  31.51 
 
 
1130 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
1066 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
1073 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  33.45 
 
 
1073 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.42 
 
 
777 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  30.57 
 
 
1127 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
1073 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
1055 aa  217  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.02 
 
 
1084 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.09 
 
 
1087 aa  215  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.65 
 
 
988 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 
1082 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  29.86 
 
 
1067 aa  214  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  31.92 
 
 
1120 aa  214  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  31.58 
 
 
1142 aa  214  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.48 
 
 
977 aa  212  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
1068 aa  211  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 
950 aa  210  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.68 
 
 
985 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  30.84 
 
 
1178 aa  209  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  30.68 
 
 
1077 aa  207  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  32.24 
 
 
509 aa  207  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
1139 aa  207  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.52 
 
 
914 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  29.78 
 
 
1904 aa  207  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.71 
 
 
1112 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  30.81 
 
 
1120 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.88 
 
 
1362 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  31.82 
 
 
1156 aa  206  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.09 
 
 
1070 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
1403 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  29.11 
 
 
918 aa  204  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
1021 aa  204  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
1155 aa  204  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  30.34 
 
 
1769 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  30.8 
 
 
1031 aa  203  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  30.86 
 
 
1025 aa  203  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.01 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>