More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12368 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12368  predicted protein  100 
 
 
126 aa  263  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138069  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  76.19 
 
 
1053 aa  208  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  75.4 
 
 
1698 aa  205  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  73.02 
 
 
1557 aa  201  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  69.84 
 
 
1246 aa  193  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  53.97 
 
 
1269 aa  155  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  53.97 
 
 
1612 aa  154  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  53.17 
 
 
1765 aa  152  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  55.12 
 
 
970 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  54.76 
 
 
589 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  55.91 
 
 
1431 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  54.84 
 
 
995 aa  147  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  57.38 
 
 
1407 aa  147  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  53.54 
 
 
1096 aa  146  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  53.54 
 
 
956 aa  146  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  56.45 
 
 
1023 aa  145  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  57.48 
 
 
609 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  57.03 
 
 
1222 aa  145  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  55.12 
 
 
1111 aa  145  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  54.84 
 
 
1566 aa  144  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  56.41 
 
 
1193 aa  141  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  54.55 
 
 
926 aa  140  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  52.76 
 
 
1259 aa  139  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  54.03 
 
 
1067 aa  139  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  53.54 
 
 
860 aa  137  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  50.39 
 
 
663 aa  137  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  47.62 
 
 
1326 aa  136  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  54.76 
 
 
522 aa  136  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  50 
 
 
1558 aa  135  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  53.45 
 
 
711 aa  134  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  52.42 
 
 
1414 aa  134  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  52.42 
 
 
1517 aa  132  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  48.84 
 
 
1901 aa  131  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  52.5 
 
 
1904 aa  130  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  48.06 
 
 
1848 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  50.4 
 
 
1519 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  44.6 
 
 
509 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  51.28 
 
 
939 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  48.41 
 
 
1107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  48.82 
 
 
868 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  48.41 
 
 
832 aa  124  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  50 
 
 
1077 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
1112 aa  123  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  41.86 
 
 
1016 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  47.62 
 
 
1181 aa  122  2e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
1069 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  46.03 
 
 
1071 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  50.42 
 
 
495 aa  120  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  42.86 
 
 
1093 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  46.22 
 
 
993 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  46.77 
 
 
509 aa  118  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  45.83 
 
 
1769 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  45.24 
 
 
1068 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  49.19 
 
 
1142 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
1091 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  48.41 
 
 
1386 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  48.41 
 
 
1354 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  46.83 
 
 
1112 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  47.62 
 
 
1362 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
1068 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  45.97 
 
 
1120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  45.97 
 
 
1120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  43.65 
 
 
1066 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
982 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  42.06 
 
 
842 aa  114  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  45.24 
 
 
1068 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
1403 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  46.03 
 
 
1064 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  41.73 
 
 
818 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  46.03 
 
 
1031 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  46.03 
 
 
1064 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  44.35 
 
 
1164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
1082 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  51.97 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
1055 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  44.09 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  45.16 
 
 
1164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  42.06 
 
 
1021 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  46.03 
 
 
1084 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
848 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
1068 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  44.44 
 
 
1062 aa  110  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  42.86 
 
 
809 aa  110  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  39.37 
 
 
833 aa  110  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
1068 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  42.86 
 
 
1087 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  44.53 
 
 
1088 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  44.53 
 
 
1088 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  45.97 
 
 
1159 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  42.19 
 
 
821 aa  109  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  43.65 
 
 
1032 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  41.27 
 
 
1080 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  45.24 
 
 
1073 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  44.83 
 
 
898 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  44.44 
 
 
1064 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
1139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  42.86 
 
 
1134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  44.44 
 
 
1064 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
1066 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  45.24 
 
 
1437 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>