More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03920 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  100 
 
 
993 aa  2061    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  36.7 
 
 
1011 aa  479  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  38.08 
 
 
821 aa  369  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  37.01 
 
 
833 aa  323  7e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  38.99 
 
 
809 aa  293  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  32.67 
 
 
821 aa  291  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  41.45 
 
 
818 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  35.79 
 
 
983 aa  267  7e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  37.86 
 
 
975 aa  241  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  35.81 
 
 
545 aa  234  6e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  34.1 
 
 
1067 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  36 
 
 
711 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  35.08 
 
 
1193 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  31.63 
 
 
688 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  35.24 
 
 
1222 aa  195  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  31.55 
 
 
1111 aa  191  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  32.67 
 
 
1431 aa  187  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  31.48 
 
 
1096 aa  184  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  30.02 
 
 
956 aa  179  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  32.31 
 
 
860 aa  177  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  31.53 
 
 
970 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  31.9 
 
 
1517 aa  175  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  32.66 
 
 
509 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  33.33 
 
 
1414 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  34.25 
 
 
1407 aa  168  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  34.68 
 
 
522 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  30.48 
 
 
495 aa  167  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  29.26 
 
 
1558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  32.93 
 
 
1259 aa  165  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.57 
 
 
1025 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  30.57 
 
 
995 aa  165  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  34.12 
 
 
479 aa  164  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  29.03 
 
 
1386 aa  160  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  29.54 
 
 
1901 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  28.54 
 
 
663 aa  160  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  30.72 
 
 
1023 aa  158  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  28.74 
 
 
773 aa  158  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.63 
 
 
1362 aa  157  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  30.72 
 
 
663 aa  157  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  32.63 
 
 
1566 aa  156  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
1139 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1112 aa  153  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  26.26 
 
 
1443 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  29.87 
 
 
1904 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  27.03 
 
 
1134 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.03 
 
 
1102 aa  152  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  28.39 
 
 
902 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  29.78 
 
 
589 aa  152  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  29.12 
 
 
1016 aa  151  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
1120 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  29.11 
 
 
535 aa  148  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.41 
 
 
1848 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 
1090 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.26 
 
 
1082 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  27.29 
 
 
1394 aa  144  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 
1082 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01650  DNA dependent ATPase, putative  24.21 
 
 
1036 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  30.47 
 
 
1519 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  25.77 
 
 
1194 aa  141  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  24.95 
 
 
1178 aa  141  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  27.85 
 
 
1381 aa  141  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  30.83 
 
 
1120 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
1155 aa  140  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
982 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  31.43 
 
 
1088 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
1110 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  26.15 
 
 
1077 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
876 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.82 
 
 
1437 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  27.44 
 
 
1073 aa  138  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  31.94 
 
 
1326 aa  138  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
1091 aa  138  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  30.56 
 
 
1120 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
1403 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  31.55 
 
 
1088 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
1068 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  31.27 
 
 
1112 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.89 
 
 
1068 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  26 
 
 
621 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  27.82 
 
 
1031 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  25.84 
 
 
1003 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  27.72 
 
 
1087 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 
1068 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
1069 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.85 
 
 
1034 aa  135  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
1069 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  26.3 
 
 
777 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  27.1 
 
 
1032 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  25.87 
 
 
1141 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.05 
 
 
1071 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  30.99 
 
 
891 aa  135  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  25.81 
 
 
1150 aa  135  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  31.75 
 
 
1127 aa  135  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
1108 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  30.77 
 
 
1161 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  29.74 
 
 
1181 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  30 
 
 
1142 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30 
 
 
959 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  28.14 
 
 
1769 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  26.65 
 
 
1832 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0976773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>