More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62265 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  51.82 
 
 		 1698 aa  944    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  47.63 
 
 		 1246 aa  823    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  100 
 
 		 1557 aa  3228    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  46.89 
 
 		 1053 aa  641    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  56.52 
 
 		 248 aa  329  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  43.9 
 
 		 1269 aa  322  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  41.01 
 
 		 1612 aa  312  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  42.28 
 
 		 1765 aa  306  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  42.64 
 
 		 1407 aa  263  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  42.22 
 
 		 1566 aa  261  9e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  40.85 
 
 		 956 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  42.3 
 
 		 1558 aa  259  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  41.72 
 
 		 589 aa  255  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  41.95 
 
 		 1259 aa  253  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  39.35 
 
 		 995 aa  251  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  41.51 
 
 		 926 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  42 
 
 		 868 aa  244  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  40.73 
 
 		 1111 aa  243  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  40.12 
 
 		 1096 aa  242  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  35.58 
 
 		 1431 aa  238  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  37.5 
 
 		 970 aa  238  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  40.98 
 
 		 1023 aa  235  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  39.09 
 
 		 1222 aa  229  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  41.99 
 
 		 509 aa  227  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  37.65 
 
 		 1519 aa  224  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  40.37 
 
 		 832 aa  220  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 1414 aa  214  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  37.91 
 
 		 1156 aa  213  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  39.13 
 
 		 860 aa  207  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.11 
 
 		 1901 aa  202  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 1082 aa  198  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  34.62 
 
 		 1093 aa  198  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12368  predicted protein  73.02 
 
 		 126 aa  197  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  33.25 
 
 		 1078 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 1091 aa  194  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 1112 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 		 1048 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  35.31 
 
 		 522 aa  194  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  33.61 
 
 		 1904 aa  193  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  34.33 
 
 		 1087 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  35.63 
 
 		 1077 aa  193  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  35.18 
 
 		 1848 aa  192  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  35.44 
 
 		 777 aa  192  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.99 
 
 		 1072 aa  191  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.89 
 
 		 1068 aa  191  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.71 
 
 		 1068 aa  189  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 1129 aa  189  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  32 
 
 		 959 aa  188  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  33.33 
 
 		 1134 aa  187  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  33.6 
 
 		 918 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.6 
 
 		 918 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  33.6 
 
 		 918 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  33.6 
 
 		 918 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 1069 aa  187  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 918 aa  187  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  34.4 
 
 		 918 aa  186  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 918 aa  186  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 1112 aa  186  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1047 aa  186  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 1139 aa  186  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  34.4 
 
 		 918 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  33.51 
 
 		 918 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1047 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.1 
 
 		 1071 aa  185  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  33.51 
 
 		 918 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  34.53 
 
 		 1181 aa  183  2e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 1068 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.72 
 
 		 977 aa  181  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.63 
 
 		 1082 aa  181  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 933 aa  180  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  34.78 
 
 		 621 aa  180  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 		 918 aa  180  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  31.71 
 
 		 1769 aa  178  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  36.28 
 
 		 1107 aa  178  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.71 
 
 		 1125 aa  178  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.21 
 
 		 1102 aa  178  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  34.4 
 
 		 663 aa  177  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 924 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.1 
 
 		 1084 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 1021 aa  177  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  31.22 
 
 		 1048 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 1108 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 1110 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  36.34 
 
 		 939 aa  176  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.33 
 
 		 1250 aa  175  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 		 1090 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.92 
 
 		 1091 aa  174  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 1105 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.62 
 
 		 666 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  35.48 
 
 		 479 aa  174  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 925 aa  174  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  34.44 
 
 		 1019 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 		 848 aa  174  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.63 
 
 		 1227 aa  173  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.44 
 
 		 773 aa  173  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 876 aa  173  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  32.84 
 
 		 1161 aa  173  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 1055 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  31.66 
 
 		 1003 aa  172  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 1120 aa  172  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>