More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4016 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  100 
 
 		 248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  60.15 
 
 		 1246 aa  330  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  60.89 
 
 		 1053 aa  329  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  56.92 
 
 		 1698 aa  328  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  56.52 
 
 		 1557 aa  328  5.0000000000000004e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  51.37 
 
 		 1612 aa  279  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  50.2 
 
 		 1269 aa  270  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  48.44 
 
 		 1765 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  47.18 
 
 		 956 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  46.46 
 
 		 1566 aa  236  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  44.14 
 
 		 995 aa  232  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  44.62 
 
 		 1407 aa  222  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  45.67 
 
 		 1558 aa  216  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  42.55 
 
 		 926 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  43.7 
 
 		 1023 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  43.7 
 
 		 1431 aa  212  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  43.82 
 
 		 1259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  45.99 
 
 		 1111 aa  211  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  44.3 
 
 		 1096 aa  211  7.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.35 
 
 		 589 aa  209  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  46.44 
 
 		 1222 aa  208  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  40.78 
 
 		 970 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  41.92 
 
 		 868 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  42.23 
 
 		 1519 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  42.25 
 
 		 1093 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  40.75 
 
 		 832 aa  194  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  43.43 
 
 		 1156 aa  192  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.8 
 
 		 1077 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  41.53 
 
 		 621 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 1414 aa  184  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  40.73 
 
 		 666 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1087 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 		 1112 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  42.08 
 
 		 860 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  40.73 
 
 		 1105 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1088 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.92 
 
 		 1068 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.73 
 
 		 1178 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1088 aa  178  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.6 
 
 		 933 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 		 1082 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.37 
 
 		 1139 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 1069 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  40.96 
 
 		 1084 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  40.56 
 
 		 1084 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 		 1129 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 1108 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  40.71 
 
 		 1107 aa  175  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 1091 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40.4 
 
 		 1125 aa  174  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 		 1047 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.11 
 
 		 1062 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  37.22 
 
 		 509 aa  173  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  41.6 
 
 		 1047 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  39.11 
 
 		 663 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40 
 
 		 1078 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 		 1105 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  39.68 
 
 		 1072 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  37.55 
 
 		 522 aa  171  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40 
 
 		 1091 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  38.89 
 
 		 1901 aa  171  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  36.8 
 
 		 1048 aa  171  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.71 
 
 		 1082 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.96 
 
 		 959 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 		 1112 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  41.37 
 
 		 1181 aa  170  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1068 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1071 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 		 1048 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  39.2 
 
 		 924 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  41.91 
 
 		 1025 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.55 
 
 		 977 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 		 925 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.84 
 
 		 914 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  41.13 
 
 		 1080 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  40.41 
 
 		 985 aa  168  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  37.9 
 
 		 1130 aa  168  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  40.17 
 
 		 1100 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  38.71 
 
 		 773 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.45 
 
 		 1134 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  41.42 
 
 		 918 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  40.73 
 
 		 1126 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  39.6 
 
 		 872 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  36 
 
 		 1003 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 		 1068 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  38 
 
 		 886 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38 
 
 		 982 aa  165  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  35.74 
 
 		 1904 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 1090 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 		 876 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.43 
 
 		 1227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  38.15 
 
 		 1031 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  36.29 
 
 		 777 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 1089 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  41.15 
 
 		 988 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  36 
 
 		 1386 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 1155 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  36.55 
 
 		 1084 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.55 
 
 		 1102 aa  162  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  37.85 
 
 		 918 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>