More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30157 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  56.81 
 
 		 1111 aa  1151    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  57.49 
 
 		 860 aa  1000    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  39.57 
 
 		 1431 aa  689    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  53.78 
 
 		 1096 aa  1009    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  40.57 
 
 		 970 aa  638    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  42.05 
 
 		 1023 aa  700    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  44.54 
 
 		 956 aa  810    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  100 
 
 		 1222 aa  2518    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  48.78 
 
 		 1407 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  47.14 
 
 		 1566 aa  480  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  47.84 
 
 		 1558 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  47.47 
 
 		 995 aa  476  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  47.96 
 
 		 1259 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  43.6 
 
 		 1414 aa  467  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  42.55 
 
 		 1517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  44.75 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  43.23 
 
 		 522 aa  446  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  40.17 
 
 		 1519 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  41.87 
 
 		 509 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  43.9 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  44.26 
 
 		 1156 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  40.7 
 
 		 663 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  42.89 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  40.81 
 
 		 1326 aa  338  5e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.65 
 
 		 1112 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  34.32 
 
 		 1443 aa  321  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.58 
 
 		 939 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  34.82 
 
 		 1067 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 1139 aa  298  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  34.32 
 
 		 1193 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  37.24 
 
 		 1107 aa  294  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.87 
 
 		 1848 aa  293  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  35.14 
 
 		 1093 aa  293  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.61 
 
 		 1077 aa  290  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  38.07 
 
 		 531 aa  289  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.87 
 
 		 1068 aa  289  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  34.35 
 
 		 1901 aa  288  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  34.05 
 
 		 609 aa  287  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 		 1091 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.64 
 
 		 1071 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  33.16 
 
 		 1904 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.99 
 
 		 1070 aa  283  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1069 aa  283  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  34.98 
 
 		 711 aa  282  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  34.54 
 
 		 1178 aa  282  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 1068 aa  282  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  35.27 
 
 		 1769 aa  282  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.9 
 
 		 1080 aa  279  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  36.63 
 
 		 1134 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  34.26 
 
 		 1087 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 1082 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.55 
 
 		 1068 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1104 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  32.17 
 
 		 1161 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.16 
 
 		 777 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  36.23 
 
 		 1082 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  35.88 
 
 		 1082 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  36.09 
 
 		 1082 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  32.99 
 
 		 1125 aa  274  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 		 1171 aa  274  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 982 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 		 876 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  35 
 
 		 1072 aa  273  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1088 aa  271  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 1073 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1088 aa  269  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  40.77 
 
 		 1612 aa  269  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.01 
 
 		 1062 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  35.26 
 
 		 918 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 1073 aa  268  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 1055 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  35.81 
 
 		 1073 aa  268  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.26 
 
 		 914 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  34.79 
 
 		 1181 aa  267  8e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  32.22 
 
 		 621 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 1108 aa  267  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  31.91 
 
 		 648 aa  266  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  42.42 
 
 		 926 aa  266  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 		 1073 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 		 1120 aa  265  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 1073 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  33.2 
 
 		 980 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 		 1090 aa  263  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 1112 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 1069 aa  263  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 		 1068 aa  261  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  34.04 
 
 		 1086 aa  261  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  33.54 
 
 		 1112 aa  261  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  35.32 
 
 		 896 aa  261  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.12 
 
 		 773 aa  261  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 1070 aa  260  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.69 
 
 		 663 aa  260  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  34.07 
 
 		 1209 aa  260  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  34.82 
 
 		 1003 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  34.34 
 
 		 872 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  32.53 
 
 		 1141 aa  258  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.47 
 
 		 1084 aa  257  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  33.68 
 
 		 1064 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  34.35 
 
 		 964 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  33.61 
 
 		 1064 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>