More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02285 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  100 
 
 
1612 aa  3346    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  54.79 
 
 
1269 aa  1071    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  54.26 
 
 
1765 aa  642    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  41.01 
 
 
1557 aa  311  9e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  43.23 
 
 
1246 aa  309  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  43.54 
 
 
1698 aa  303  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  41.64 
 
 
1053 aa  303  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  51.37 
 
 
248 aa  279  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  44.07 
 
 
995 aa  275  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  40.77 
 
 
1222 aa  268  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  40.18 
 
 
1566 aa  264  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  40.5 
 
 
1111 aa  263  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  33.05 
 
 
1431 aa  262  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  39.16 
 
 
956 aa  259  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  41.1 
 
 
1407 aa  258  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  40.74 
 
 
1096 aa  254  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  42.02 
 
 
1259 aa  251  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  37.5 
 
 
1558 aa  249  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  41.64 
 
 
1023 aa  248  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  37.96 
 
 
970 aa  243  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  38.01 
 
 
926 aa  238  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  41.25 
 
 
868 aa  235  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  38.39 
 
 
1519 aa  232  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  38.23 
 
 
589 aa  229  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  39.86 
 
 
860 aa  223  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
832 aa  220  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  35 
 
 
1414 aa  210  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  37.07 
 
 
1107 aa  208  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  38.73 
 
 
522 aa  208  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  37.79 
 
 
1156 aa  207  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  36.84 
 
 
1093 aa  203  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  38.91 
 
 
509 aa  202  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.6 
 
 
1087 aa  201  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  33.23 
 
 
1517 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  34.48 
 
 
1161 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
1112 aa  189  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  36.09 
 
 
479 aa  189  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  34.35 
 
 
1901 aa  187  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.85 
 
 
1077 aa  185  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1105 aa  184  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 
1090 aa  184  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  33.66 
 
 
1072 aa  183  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
1108 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  32.82 
 
 
1078 aa  182  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.68 
 
 
1134 aa  181  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  33.13 
 
 
666 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
1105 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.23 
 
 
1112 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.01 
 
 
1326 aa  180  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 
1091 aa  179  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
1069 aa  179  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  33.93 
 
 
918 aa  179  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.8 
 
 
1250 aa  178  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  33.96 
 
 
1178 aa  178  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
933 aa  178  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
1082 aa  178  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  31.16 
 
 
773 aa  178  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
1129 aa  178  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  34.58 
 
 
1194 aa  177  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.06 
 
 
1125 aa  177  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.08 
 
 
1071 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.08 
 
 
1068 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.81 
 
 
777 aa  177  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.05 
 
 
1080 aa  177  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
1028 aa  176  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  33.13 
 
 
1443 aa  176  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  33.63 
 
 
918 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  33.43 
 
 
1141 aa  175  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.72 
 
 
939 aa  175  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  33.65 
 
 
959 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.11 
 
 
1227 aa  174  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.28 
 
 
914 aa  174  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
1120 aa  174  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
1139 aa  174  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
1110 aa  174  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  33.43 
 
 
918 aa  173  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  30.68 
 
 
924 aa  173  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.13 
 
 
1062 aa  173  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  32.14 
 
 
980 aa  174  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  32.28 
 
 
1047 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  31.16 
 
 
663 aa  174  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
1047 aa  174  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
1048 aa  173  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  33.13 
 
 
918 aa  172  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.13 
 
 
918 aa  172  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  33.13 
 
 
918 aa  172  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  33.13 
 
 
918 aa  172  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  31.96 
 
 
918 aa  172  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  33.13 
 
 
918 aa  171  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
918 aa  172  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  33.13 
 
 
918 aa  171  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  32.82 
 
 
1100 aa  171  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.49 
 
 
621 aa  171  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.33 
 
 
1068 aa  171  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
1068 aa  171  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  32.14 
 
 
1848 aa  171  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
1050 aa  170  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  33.65 
 
 
1069 aa  170  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
1089 aa  170  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.95 
 
 
1088 aa  169  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>