More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06010 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  55.45 
 
 
1612 aa  659    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  51.07 
 
 
1269 aa  919    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1765 aa  3623    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  42.16 
 
 
1557 aa  305  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  42.49 
 
 
1698 aa  294  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  42.44 
 
 
1053 aa  286  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  40.76 
 
 
1246 aa  276  4.0000000000000004e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  43.77 
 
 
995 aa  266  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  48.44 
 
 
248 aa  262  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.41 
 
 
1566 aa  260  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  40.72 
 
 
970 aa  259  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  38.66 
 
 
956 aa  258  8e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  33.8 
 
 
1431 aa  256  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  39.52 
 
 
1111 aa  254  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  37.82 
 
 
1096 aa  251  6e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.72 
 
 
1407 aa  248  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  40.38 
 
 
1558 aa  248  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  38.6 
 
 
1222 aa  246  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  41.72 
 
 
1023 aa  243  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  41 
 
 
926 aa  241  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  39.51 
 
 
1259 aa  239  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  40.68 
 
 
868 aa  231  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  39.86 
 
 
832 aa  223  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  37.65 
 
 
589 aa  221  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  38.54 
 
 
1519 aa  214  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  36.7 
 
 
860 aa  209  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  39.45 
 
 
509 aa  207  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  37.89 
 
 
522 aa  206  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  35.67 
 
 
1414 aa  203  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  35.57 
 
 
1156 aa  201  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.7 
 
 
1107 aa  195  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  32.03 
 
 
1161 aa  194  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  36.31 
 
 
1093 aa  193  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
1112 aa  192  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.24 
 
 
1087 aa  188  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  33.85 
 
 
1134 aa  187  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  36.17 
 
 
479 aa  187  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.74 
 
 
1068 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
1091 aa  185  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
1082 aa  184  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  34.52 
 
 
1901 aa  184  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  35.49 
 
 
1178 aa  184  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
1104 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.8 
 
 
1071 aa  183  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
1069 aa  183  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  34.76 
 
 
1443 aa  182  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.83 
 
 
1077 aa  180  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
1069 aa  180  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 
1090 aa  179  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  32.29 
 
 
1517 aa  179  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
1120 aa  179  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  32.63 
 
 
1078 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.59 
 
 
1082 aa  177  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  34.39 
 
 
1386 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.11 
 
 
1080 aa  177  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  35.46 
 
 
1326 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
1108 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  35.11 
 
 
1437 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
1068 aa  176  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
1155 aa  175  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  31.99 
 
 
1209 aa  176  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 
1110 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.06 
 
 
777 aa  175  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 
1403 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  34.08 
 
 
1362 aa  174  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  34.18 
 
 
1068 aa  174  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.3 
 
 
1026 aa  174  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
1357 aa  174  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
1050 aa  173  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
1028 aa  173  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  32.18 
 
 
773 aa  172  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.14 
 
 
1125 aa  172  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
1112 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.23 
 
 
1105 aa  172  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  30.89 
 
 
990 aa  172  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
1105 aa  172  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  38.69 
 
 
872 aa  172  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.38 
 
 
1072 aa  172  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  31.85 
 
 
1150 aa  172  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  33.96 
 
 
1127 aa  171  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  36.13 
 
 
1088 aa  171  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  36.36 
 
 
1084 aa  171  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  33.23 
 
 
666 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  36.13 
 
 
1088 aa  171  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
1139 aa  171  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.54 
 
 
1102 aa  171  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
1129 aa  170  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  34.06 
 
 
1062 aa  170  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.63 
 
 
621 aa  170  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
1074 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  36.73 
 
 
1084 aa  170  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  32.63 
 
 
1394 aa  169  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.86 
 
 
991 aa  169  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.56 
 
 
1100 aa  169  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 
876 aa  169  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
1089 aa  168  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.18 
 
 
663 aa  168  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  31.4 
 
 
958 aa  167  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.42 
 
 
914 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
933 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>