More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15881 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  100 
 
 
1326 aa  2733    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  37.55 
 
 
1517 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  45.4 
 
 
495 aa  422  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  35.65 
 
 
1414 aa  404  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  37.09 
 
 
1519 aa  393  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  36.79 
 
 
663 aa  390  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  43.06 
 
 
479 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  40.04 
 
 
1096 aa  361  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  35.84 
 
 
1023 aa  361  5e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  39.39 
 
 
1111 aa  356  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  40.76 
 
 
1222 aa  352  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  35.6 
 
 
956 aa  348  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  36.78 
 
 
1259 aa  342  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  39.88 
 
 
860 aa  337  7.999999999999999e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  35.82 
 
 
970 aa  335  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  35.63 
 
 
1566 aa  335  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  35.26 
 
 
1558 aa  332  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  36.76 
 
 
1407 aa  327  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  36.69 
 
 
995 aa  326  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  36.91 
 
 
589 aa  325  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  36.4 
 
 
522 aa  319  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  37.27 
 
 
1431 aa  318  6e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  37.92 
 
 
531 aa  312  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  28.29 
 
 
1443 aa  297  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  37.14 
 
 
509 aa  296  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  35.5 
 
 
711 aa  279  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  35.89 
 
 
1156 aa  271  8.999999999999999e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  32.77 
 
 
1107 aa  260  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.57 
 
 
1112 aa  243  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  28.12 
 
 
1093 aa  242  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  29.88 
 
 
939 aa  242  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  30 
 
 
1193 aa  241  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  31.39 
 
 
609 aa  233  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  30.95 
 
 
821 aa  231  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  30.12 
 
 
1067 aa  229  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
1139 aa  229  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
1082 aa  224  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 
1021 aa  224  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.88 
 
 
833 aa  223  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.3 
 
 
1087 aa  224  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  31.7 
 
 
648 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  31.41 
 
 
1077 aa  222  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.11 
 
 
1034 aa  219  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.43 
 
 
1071 aa  218  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
1055 aa  218  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  31.95 
 
 
959 aa  218  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.92 
 
 
1250 aa  218  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
1403 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
1091 aa  216  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.98 
 
 
777 aa  215  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  32.16 
 
 
1848 aa  214  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
1108 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  29.32 
 
 
1142 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.34 
 
 
1068 aa  214  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  31.12 
 
 
1068 aa  213  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  30.33 
 
 
1064 aa  213  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
1261 aa  213  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  30.5 
 
 
1386 aa  212  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  31.61 
 
 
818 aa  211  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  29.4 
 
 
1901 aa  211  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
1069 aa  210  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  30.23 
 
 
1769 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  31.01 
 
 
1178 aa  210  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  31.4 
 
 
1437 aa  210  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.36 
 
 
1354 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.15 
 
 
1072 aa  210  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  28.23 
 
 
1185 aa  210  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.41 
 
 
621 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  30.95 
 
 
1181 aa  209  4e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  29.52 
 
 
1362 aa  209  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
1068 aa  208  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.41 
 
 
1064 aa  208  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
1102 aa  208  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
1068 aa  208  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
1171 aa  207  8e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  29.6 
 
 
1064 aa  207  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  31.49 
 
 
1064 aa  207  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  30.71 
 
 
1025 aa  207  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  29.6 
 
 
1064 aa  207  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  29.71 
 
 
975 aa  207  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.94 
 
 
1078 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  29.6 
 
 
1064 aa  207  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.33 
 
 
1086 aa  207  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  29.23 
 
 
1064 aa  206  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
1152 aa  206  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.6 
 
 
1064 aa  206  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  29.6 
 
 
1064 aa  207  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  29.72 
 
 
988 aa  206  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.39 
 
 
1227 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  28.66 
 
 
964 aa  205  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
1105 aa  205  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.48 
 
 
977 aa  205  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  30.43 
 
 
1070 aa  205  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
1068 aa  204  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  29.63 
 
 
1003 aa  204  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  29.16 
 
 
1125 aa  204  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  30.1 
 
 
983 aa  204  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.15 
 
 
1080 aa  204  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  29.72 
 
 
902 aa  203  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1112 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>