More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83690 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  47.96 
 
 
1407 aa  1112    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  45.56 
 
 
1558 aa  935    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  44.27 
 
 
995 aa  661    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  61.72 
 
 
1259 aa  1006    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  100 
 
 
1566 aa  3211    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  42.6 
 
 
956 aa  490  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  47.14 
 
 
1222 aa  480  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  42.86 
 
 
1431 aa  466  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  40.98 
 
 
970 aa  462  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  47.22 
 
 
1096 aa  457  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  39.74 
 
 
1023 aa  454  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  45.61 
 
 
1111 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  42.91 
 
 
1414 aa  436  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  33.54 
 
 
1156 aa  429  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  40.78 
 
 
589 aa  419  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  43.39 
 
 
1519 aa  410  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  46.44 
 
 
860 aa  409  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  41.04 
 
 
1517 aa  403  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  40.82 
 
 
509 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  41.19 
 
 
522 aa  373  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  40.57 
 
 
663 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  39.31 
 
 
495 aa  360  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  39.42 
 
 
1443 aa  345  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  37.5 
 
 
479 aa  333  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  34.54 
 
 
1326 aa  317  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  34.88 
 
 
1107 aa  301  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.47 
 
 
1087 aa  295  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.4 
 
 
1193 aa  294  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  33.73 
 
 
939 aa  294  9e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
1112 aa  290  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.86 
 
 
1901 aa  287  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  33.57 
 
 
1093 aa  286  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
1139 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.79 
 
 
1848 aa  280  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
1082 aa  279  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  33.96 
 
 
1067 aa  277  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  33.78 
 
 
1904 aa  275  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.03 
 
 
1077 aa  275  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.86 
 
 
1125 aa  273  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.25 
 
 
1068 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  31.86 
 
 
1769 aa  270  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  33.33 
 
 
711 aa  268  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
1091 aa  266  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  45.18 
 
 
926 aa  265  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  42.41 
 
 
1698 aa  265  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  40.06 
 
 
1612 aa  265  6e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.56 
 
 
1071 aa  264  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  49.3 
 
 
832 aa  261  5.0000000000000005e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  42.22 
 
 
1557 aa  260  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  39.76 
 
 
1269 aa  260  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
982 aa  259  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 
1069 aa  258  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  43.42 
 
 
868 aa  258  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  38.74 
 
 
1765 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  32.45 
 
 
1064 aa  255  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  32.52 
 
 
1064 aa  255  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
1069 aa  255  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  42.38 
 
 
1246 aa  254  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  30.48 
 
 
648 aa  254  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  32.12 
 
 
1064 aa  254  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  32.32 
 
 
1064 aa  254  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  32.32 
 
 
1064 aa  254  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  32.32 
 
 
1064 aa  254  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  32.32 
 
 
1064 aa  254  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.62 
 
 
1082 aa  253  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  32.12 
 
 
1064 aa  253  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
1055 aa  252  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.67 
 
 
1068 aa  251  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  32.11 
 
 
1064 aa  251  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  39.09 
 
 
1053 aa  251  9e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.06 
 
 
1062 aa  250  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.52 
 
 
1181 aa  249  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
1068 aa  249  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
1112 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  34.35 
 
 
773 aa  248  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
1171 aa  248  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  32.66 
 
 
1066 aa  248  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  33.05 
 
 
609 aa  248  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  34.28 
 
 
531 aa  248  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
1104 aa  247  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
1120 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
950 aa  247  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  32.32 
 
 
1357 aa  246  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 
1068 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.19 
 
 
1134 aa  244  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  33.13 
 
 
1003 aa  245  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  32.92 
 
 
1047 aa  245  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
1047 aa  245  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
1089 aa  244  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  34.46 
 
 
1031 aa  244  7e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  34.35 
 
 
663 aa  244  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  30.97 
 
 
1178 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
1155 aa  244  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
1021 aa  244  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.8 
 
 
1084 aa  244  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  30.77 
 
 
1386 aa  243  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  32.39 
 
 
959 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.22 
 
 
977 aa  243  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 
876 aa  243  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.97 
 
 
1362 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>