More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54310 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  100 
 
 
531 aa  1112    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  44.72 
 
 
495 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  45.17 
 
 
479 aa  361  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  39.5 
 
 
1519 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  37.28 
 
 
663 aa  353  5e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  37.89 
 
 
1414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  39.41 
 
 
1517 aa  335  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  37.92 
 
 
1326 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  38.07 
 
 
1222 aa  306  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  37.16 
 
 
1111 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  37.33 
 
 
956 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  36.66 
 
 
995 aa  282  9e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  37.95 
 
 
1023 aa  273  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  34.9 
 
 
1096 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  34.28 
 
 
1566 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  34.51 
 
 
1259 aa  267  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.78 
 
 
1407 aa  266  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  35.02 
 
 
1558 aa  263  8e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  32.25 
 
 
1443 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  33.55 
 
 
970 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  35.06 
 
 
589 aa  256  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  34.71 
 
 
860 aa  254  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  34.84 
 
 
1431 aa  253  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  33.96 
 
 
509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  32.74 
 
 
522 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  31.87 
 
 
1067 aa  213  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
1021 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  30.94 
 
 
926 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  31.9 
 
 
1156 aa  207  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  31.32 
 
 
1107 aa  206  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  30.79 
 
 
1193 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
1055 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
1068 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
1112 aa  200  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  30.45 
 
 
939 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
1139 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  29.51 
 
 
621 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  31.65 
 
 
1161 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  31.77 
 
 
1093 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.2 
 
 
1112 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
1082 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  29.32 
 
 
777 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
1091 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
848 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  29.51 
 
 
711 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  28.84 
 
 
1087 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
1110 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  27.85 
 
 
1901 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.42 
 
 
1250 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04120  Pol II transcription elongation factor, putative  33.14 
 
 
902 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  28.41 
 
 
1065 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  30.42 
 
 
1769 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
1066 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  29.22 
 
 
891 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  30.84 
 
 
1070 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.31 
 
 
1068 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  30.32 
 
 
1082 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  30.52 
 
 
1080 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  28.25 
 
 
1904 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.85 
 
 
1227 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
1069 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
1113 aa  183  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  29.56 
 
 
1113 aa  183  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  29.93 
 
 
914 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  30.09 
 
 
1082 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  30.09 
 
 
1082 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
1090 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  29.91 
 
 
918 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  29.93 
 
 
1088 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
1112 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
982 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.26 
 
 
1071 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.87 
 
 
1067 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
1073 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  30.02 
 
 
1019 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.98 
 
 
1084 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  30.16 
 
 
1088 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
1073 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  27.52 
 
 
1063 aa  180  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.57 
 
 
1099 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
1073 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  37.5 
 
 
868 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.66 
 
 
1848 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
1073 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.54 
 
 
1068 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  27.89 
 
 
1069 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30 
 
 
1086 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  28.77 
 
 
1181 aa  179  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  28.79 
 
 
1077 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.61 
 
 
1064 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
1261 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
1171 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  28.12 
 
 
1069 aa  177  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
950 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
1155 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.18 
 
 
1125 aa  176  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.52 
 
 
1072 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  29.61 
 
 
1064 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  29 
 
 
1108 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.61 
 
 
1064 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>