More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK03090 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  100 
 
 		 926 aa  1907    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  40.43 
 
 		 868 aa  619  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 		 832 aa  511  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  38.46 
 
 		 1111 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  52.6 
 
 		 589 aa  330  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  32.92 
 
 		 522 aa  312  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.39 
 
 		 1107 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  34.12 
 
 		 495 aa  281  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  32.41 
 
 		 1093 aa  276  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  45.19 
 
 		 509 aa  274  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  32.87 
 
 		 648 aa  272  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  45.3 
 
 		 1407 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  44.07 
 
 		 1558 aa  268  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  42.42 
 
 		 1222 aa  265  4e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  45.18 
 
 		 1566 aa  265  4e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  40.99 
 
 		 956 aa  263  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  31.95 
 
 		 939 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  42.37 
 
 		 1096 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  44.11 
 
 		 1259 aa  258  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  41.41 
 
 		 1431 aa  256  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  42.52 
 
 		 995 aa  250  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  31.03 
 
 		 609 aa  246  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  42.07 
 
 		 1023 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  41.51 
 
 		 1557 aa  245  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  41 
 
 		 1765 aa  240  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  34.32 
 
 		 970 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  38.01 
 
 		 1612 aa  238  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 1082 aa  237  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 1246 aa  228  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  37.42 
 
 		 1698 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  31.03 
 
 		 1269 aa  227  6e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 1414 aa  224  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  42.55 
 
 		 248 aa  218  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  43.21 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  39.37 
 
 		 1053 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  40.88 
 
 		 1156 aa  214  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  31.89 
 
 		 531 aa  212  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  46.46 
 
 		 860 aa  207  8e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  38.01 
 
 		 1519 aa  204  6e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  48.15 
 
 		 1517 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  28.6 
 
 		 1086 aa  185  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  33.24 
 
 		 1067 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.44 
 
 		 1193 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  37.94 
 
 		 663 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  29.39 
 
 		 901 aa  179  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  35.5 
 
 		 1901 aa  178  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  31.85 
 
 		 958 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04120  Pol II transcription elongation factor, putative  36.05 
 
 		 902 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  34.68 
 
 		 1181 aa  174  9e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 1112 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  35.27 
 
 		 1078 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  31.18 
 
 		 1072 aa  167  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  33.01 
 
 		 1904 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  32.54 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1088 aa  164  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  35.15 
 
 		 1006 aa  164  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1088 aa  164  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  35.66 
 
 		 1033 aa  164  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.6 
 
 		 1082 aa  163  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.31 
 
 		 1125 aa  164  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 1028 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 		 1110 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  33.22 
 
 		 1007 aa  163  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 1171 aa  162  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  33.11 
 
 		 903 aa  161  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1019 aa  161  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  32.52 
 
 		 1080 aa  161  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 		 1089 aa  160  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 1047 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  34.13 
 
 		 1047 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 1090 aa  160  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 1120 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  31.65 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  33.77 
 
 		 886 aa  159  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  34.51 
 
 		 918 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 1048 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.96 
 
 		 1068 aa  158  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 1112 aa  158  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.58 
 
 		 1077 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  34.74 
 
 		 1354 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 		 617 aa  157  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.15 
 
 		 914 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  35.23 
 
 		 896 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.39 
 
 		 777 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  33.55 
 
 		 1437 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  31.1 
 
 		 1031 aa  157  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  40.91 
 
 		 1326 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.12 
 
 		 1848 aa  156  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.78 
 
 		 1068 aa  156  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  34.01 
 
 		 1082 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 1069 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 1068 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.22 
 
 		 985 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  34.2 
 
 		 1088 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  30.54 
 
 		 1832 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0976773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  33.11 
 
 		 1069 aa  155  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  32.59 
 
 		 1100 aa  155  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.04 
 
 		 1026 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 876 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  31.31 
 
 		 980 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>