More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56808 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  45.46 
 
 		 1193 aa  950    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  100 
 
 		 1067 aa  2198    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  40.75 
 
 		 711 aa  535  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  35.15 
 
 		 1904 aa  320  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  35.99 
 
 		 1848 aa  318  4e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  34.58 
 
 		 1901 aa  306  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  35.75 
 
 		 1023 aa  306  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  34.82 
 
 		 1222 aa  304  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1558 aa  301  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  33.12 
 
 		 902 aa  301  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  34.76 
 
 		 589 aa  298  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  36.4 
 
 		 995 aa  295  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  36.22 
 
 		 1259 aa  293  9e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  33.17 
 
 		 821 aa  290  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32.87 
 
 		 1769 aa  290  8e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  35.2 
 
 		 1407 aa  288  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  34.17 
 
 		 956 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  34.81 
 
 		 970 aa  285  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  33.4 
 
 		 1111 aa  282  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 1021 aa  282  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  32.62 
 
 		 833 aa  279  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  28.94 
 
 		 898 aa  278  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.96 
 
 		 1566 aa  276  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  33.53 
 
 		 1431 aa  276  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  34.1 
 
 		 1069 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  34.29 
 
 		 1069 aa  268  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1139 aa  268  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  31.79 
 
 		 975 aa  265  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 1414 aa  265  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 1112 aa  261  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 1055 aa  260  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.58 
 
 		 1068 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  30.91 
 
 		 1096 aa  258  4e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  32.62 
 
 		 522 aa  258  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 		 1069 aa  257  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  27.08 
 
 		 1016 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  29.89 
 
 		 1517 aa  256  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.41 
 
 		 1071 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 777 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.95 
 
 		 1181 aa  254  6e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.11 
 
 		 1077 aa  254  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 		 1082 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 1171 aa  252  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  31.26 
 
 		 959 aa  251  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  31.49 
 
 		 1250 aa  250  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  31.06 
 
 		 545 aa  250  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  30.91 
 
 		 983 aa  250  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 		 1091 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 1112 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1125 aa  249  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  29.79 
 
 		 860 aa  249  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 1068 aa  249  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  32.52 
 
 		 509 aa  249  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 918 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.75 
 
 		 1087 aa  248  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  30.62 
 
 		 818 aa  247  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 1089 aa  247  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.41 
 
 		 1072 aa  246  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.24 
 
 		 982 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  31.18 
 
 		 891 aa  245  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  32.12 
 
 		 902 aa  244  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  32.55 
 
 		 918 aa  243  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  32.35 
 
 		 918 aa  243  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  32.35 
 
 		 918 aa  243  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  32.35 
 
 		 918 aa  243  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.27 
 
 		 1067 aa  243  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 1068 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  32.35 
 
 		 918 aa  243  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  30.8 
 
 		 663 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 		 1068 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 		 898 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  32.35 
 
 		 918 aa  241  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  32.67 
 
 		 918 aa  241  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1047 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1047 aa  241  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  30.43 
 
 		 773 aa  241  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.96 
 
 		 1354 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 1108 aa  240  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  32.35 
 
 		 918 aa  240  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  31.92 
 
 		 1127 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  32.08 
 
 		 918 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 918 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  30.02 
 
 		 535 aa  239  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  31.12 
 
 		 1519 aa  238  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.25 
 
 		 1134 aa  238  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 1403 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  32.1 
 
 		 917 aa  238  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.2 
 
 		 1080 aa  237  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.23 
 
 		 1011 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 931 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.38 
 
 		 1102 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  30.78 
 
 		 901 aa  235  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 1104 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  33.53 
 
 		 479 aa  235  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  31.18 
 
 		 1078 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.03 
 
 		 977 aa  234  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 1105 aa  234  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  30.19 
 
 		 663 aa  234  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  31.61 
 
 		 666 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30.78 
 
 		 1130 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>