More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12759 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  48.04 
 
 		 1111 aa  844    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  44.02 
 
 		 970 aa  771    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  47.46 
 
 		 1431 aa  812    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  100 
 
 		 956 aa  1985    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  50.06 
 
 		 1096 aa  838    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  47.64 
 
 		 860 aa  779    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  48.31 
 
 		 1023 aa  860    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  44.55 
 
 		 1222 aa  818    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  45.18 
 
 		 1259 aa  499  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  43.84 
 
 		 1566 aa  486  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  43.06 
 
 		 1407 aa  485  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  42.39 
 
 		 995 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  45.39 
 
 		 1558 aa  479  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  46.53 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  46.93 
 
 		 589 aa  466  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  43.63 
 
 		 1414 aa  459  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  44.93 
 
 		 1519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  41.8 
 
 		 1517 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  43.39 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  43.87 
 
 		 479 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  42.8 
 
 		 663 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  43.98 
 
 		 1156 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  42.98 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  38.78 
 
 		 1443 aa  363  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  34.31 
 
 		 1326 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.68 
 
 		 1112 aa  301  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.14 
 
 		 1077 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.87 
 
 		 1080 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  35.44 
 
 		 648 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  33.77 
 
 		 1134 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 1104 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.06 
 
 		 1848 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.83 
 
 		 1904 aa  288  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  34.17 
 
 		 1067 aa  286  9e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  34.26 
 
 		 1093 aa  286  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  33.82 
 
 		 711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 1108 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 		 1091 aa  283  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.27 
 
 		 1068 aa  283  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 1139 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  43.33 
 
 		 1053 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1088 aa  281  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.42 
 
 		 1087 aa  281  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  35.71 
 
 		 1107 aa  281  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.25 
 
 		 939 aa  281  5e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1088 aa  281  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 		 1082 aa  279  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1069 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  36.31 
 
 		 773 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  37.21 
 
 		 663 aa  278  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.44 
 
 		 1091 aa  277  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.46 
 
 		 1070 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 1113 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  35.14 
 
 		 1113 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 		 1112 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 		 1068 aa  275  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  45.82 
 
 		 868 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.83 
 
 		 1178 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  34.93 
 
 		 609 aa  274  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.01 
 
 		 777 aa  274  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 876 aa  274  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  32.99 
 
 		 1193 aa  273  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  34.09 
 
 		 1769 aa  273  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.48 
 
 		 1125 aa  273  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  34.68 
 
 		 1082 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.59 
 
 		 1071 aa  273  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 1068 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.4 
 
 		 1062 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.05 
 
 		 1068 aa  271  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  34.48 
 
 		 1082 aa  270  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  40.37 
 
 		 1698 aa  270  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  33.76 
 
 		 980 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 1120 aa  270  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  34.61 
 
 		 1082 aa  270  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  35.45 
 
 		 666 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 1105 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  37.33 
 
 		 531 aa  268  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.3 
 
 		 1100 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 1105 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  33.54 
 
 		 1386 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  33.62 
 
 		 964 aa  268  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.76 
 
 		 1181 aa  267  5.999999999999999e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  33.21 
 
 		 1901 aa  267  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.68 
 
 		 985 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  34.71 
 
 		 991 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  33.2 
 
 		 1362 aa  266  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  34.62 
 
 		 903 aa  266  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 1073 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  32.81 
 
 		 1003 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 982 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.6 
 
 		 1031 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  33.26 
 
 		 1088 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 1073 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.48 
 
 		 621 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  40.99 
 
 		 926 aa  263  8.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  32.31 
 
 		 1078 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 		 1403 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  34.75 
 
 		 1141 aa  263  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  33.91 
 
 		 918 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  34.35 
 
 		 918 aa  262  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>