More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85702 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  51.45 
 
 		 1407 aa  1094    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  46.36 
 
 		 1558 aa  918    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  100 
 
 		 1259 aa  2577    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  42.95 
 
 		 995 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  55.15 
 
 		 1566 aa  1053    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  43.15 
 
 		 956 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  47.96 
 
 		 1222 aa  469  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  46.61 
 
 		 1431 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  47.09 
 
 		 1111 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  46.83 
 
 		 1096 aa  450  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  43.34 
 
 		 970 aa  448  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  39.04 
 
 		 1023 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  38.3 
 
 		 1156 aa  433  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.03 
 
 		 589 aa  429  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 1414 aa  426  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  39.77 
 
 		 1519 aa  399  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  41.3 
 
 		 1517 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  43 
 
 		 509 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  45.43 
 
 		 860 aa  392  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  42.49 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  39.35 
 
 		 663 aa  367  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  40.9 
 
 		 495 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  37.39 
 
 		 1443 aa  337  7e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.27 
 
 		 1326 aa  323  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  37.85 
 
 		 479 aa  319  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  35.24 
 
 		 1107 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  33.73 
 
 		 1901 aa  301  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.41 
 
 		 1087 aa  298  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 1082 aa  298  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  36.22 
 
 		 1067 aa  295  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 		 1112 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.71 
 
 		 1848 aa  295  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 1139 aa  289  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  32.17 
 
 		 711 aa  288  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  32.1 
 
 		 939 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  34.69 
 
 		 1093 aa  286  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.21 
 
 		 1193 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.25 
 
 		 1077 aa  281  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.73 
 
 		 1125 aa  280  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  33.66 
 
 		 1904 aa  279  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.89 
 
 		 1068 aa  278  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  37 
 
 		 1069 aa  274  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  34.15 
 
 		 1769 aa  273  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.22 
 
 		 1084 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 1091 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 982 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  33.46 
 
 		 1069 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.77 
 
 		 1068 aa  264  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  33.97 
 
 		 1032 aa  263  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  33.52 
 
 		 1069 aa  263  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  34.76 
 
 		 1031 aa  262  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  35.06 
 
 		 959 aa  262  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.65 
 
 		 1031 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  33.33 
 
 		 1064 aa  261  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.97 
 
 		 1062 aa  260  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  40.52 
 
 		 926 aa  259  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  32.76 
 
 		 975 aa  259  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  32.96 
 
 		 1064 aa  258  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  33.27 
 
 		 1064 aa  258  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1088 aa  258  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  33.27 
 
 		 1064 aa  258  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  33.27 
 
 		 1064 aa  258  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1088 aa  258  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  33.27 
 
 		 1064 aa  258  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  33.4 
 
 		 1064 aa  258  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  33.27 
 
 		 1064 aa  257  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  33.06 
 
 		 1064 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 1068 aa  255  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  40.19 
 
 		 868 aa  254  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  35.66 
 
 		 1698 aa  253  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 1069 aa  253  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  36.27 
 
 		 1100 aa  253  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  39.52 
 
 		 1557 aa  253  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  42.02 
 
 		 1612 aa  252  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  41.98 
 
 		 1246 aa  252  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1055 aa  252  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 1021 aa  252  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.59 
 
 		 1104 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 		 1068 aa  251  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  45.89 
 
 		 832 aa  251  5e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.41 
 
 		 1034 aa  251  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.2 
 
 		 1082 aa  251  7e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.33 
 
 		 663 aa  251  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  31.69 
 
 		 1181 aa  250  1e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.28 
 
 		 1134 aa  250  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  34.53 
 
 		 1003 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  34.77 
 
 		 1084 aa  249  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.12 
 
 		 1071 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 		 1066 aa  249  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.47 
 
 		 1250 aa  249  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  35.33 
 
 		 773 aa  249  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 964 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  35.54 
 
 		 1084 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  34.51 
 
 		 531 aa  248  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  40.98 
 
 		 1053 aa  248  6e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.49 
 
 		 1080 aa  247  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  33.4 
 
 		 1150 aa  247  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.61 
 
 		 1070 aa  247  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  32.93 
 
 		 891 aa  247  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.47 
 
 		 977 aa  247  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>