More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40372 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  100 
 
 		 663 aa  1378    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  47.59 
 
 		 479 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  45.85 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  38.02 
 
 		 1517 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  38.58 
 
 		 1519 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 1414 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  42.47 
 
 		 1096 aa  392  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.53 
 
 		 1407 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  42.8 
 
 		 956 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  40.7 
 
 		 1222 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.88 
 
 		 1326 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  40.33 
 
 		 1111 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  41.55 
 
 		 1431 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  40.57 
 
 		 1566 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  41.22 
 
 		 970 aa  369  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  39.35 
 
 		 1259 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  33.87 
 
 		 1443 aa  361  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  39.27 
 
 		 995 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  40.72 
 
 		 1023 aa  350  6e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  40.99 
 
 		 860 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  36.01 
 
 		 1558 aa  342  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  39.84 
 
 		 522 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  39.96 
 
 		 589 aa  339  8e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  37.28 
 
 		 531 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  38.34 
 
 		 509 aa  312  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  39.74 
 
 		 1156 aa  310  8e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 1112 aa  276  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  31.71 
 
 		 1093 aa  253  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.08 
 
 		 1107 aa  253  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.15 
 
 		 1071 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  32.48 
 
 		 939 aa  249  9e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  32.47 
 
 		 1193 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 1091 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.52 
 
 		 1125 aa  246  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 1069 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 1082 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 		 1055 aa  243  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.35 
 
 		 1077 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  32.14 
 
 		 1068 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  30.57 
 
 		 818 aa  239  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1062 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 1139 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  32.82 
 
 		 1848 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 1112 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 1118 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  34.36 
 
 		 1096 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.19 
 
 		 663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  32.71 
 
 		 1082 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  31.49 
 
 		 1068 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.39 
 
 		 1134 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  30.82 
 
 		 1141 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  30.19 
 
 		 1067 aa  234  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 		 1068 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.25 
 
 		 1087 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 		 848 aa  233  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.6 
 
 		 991 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  32.71 
 
 		 1082 aa  233  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  32.2 
 
 		 1386 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  32.22 
 
 		 1070 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.43 
 
 		 1178 aa  233  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  32.51 
 
 		 1082 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  34.39 
 
 		 773 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  31.6 
 
 		 821 aa  231  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 985 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  30.92 
 
 		 1904 aa  230  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  31.84 
 
 		 1769 aa  230  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  32.46 
 
 		 983 aa  230  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.53 
 
 		 1072 aa  230  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.43 
 
 		 1078 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  31.57 
 
 		 1362 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 1068 aa  229  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  31.24 
 
 		 1181 aa  228  2e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 1108 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  31.26 
 
 		 1284 aa  229  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1088 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.59 
 
 		 1021 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  32.7 
 
 		 1154 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.5 
 
 		 1091 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1088 aa  228  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 1048 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 1120 aa  227  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.51 
 
 		 833 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 1113 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1159 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  31.48 
 
 		 1113 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  32.99 
 
 		 1080 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  30.87 
 
 		 545 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 1073 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  31.87 
 
 		 1069 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  32.7 
 
 		 1163 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 1073 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 1066 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 1073 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 1073 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 1028 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 1449 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  34.62 
 
 		 1033 aa  224  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  31.66 
 
 		 1069 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  31.63 
 
 		 711 aa  224  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.93 
 
 		 977 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>