More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14180 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  100 
 
 		 545 aa  1137    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  53.63 
 
 		 983 aa  585  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  49.1 
 
 		 833 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  47.03 
 
 		 821 aa  488  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  47.3 
 
 		 818 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  43.33 
 
 		 1011 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  40.29 
 
 		 809 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  38.54 
 
 		 821 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  36.13 
 
 		 688 aa  321  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  36.01 
 
 		 975 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  30.36 
 
 		 1193 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  31.84 
 
 		 711 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  31.06 
 
 		 1067 aa  250  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  33.27 
 
 		 1023 aa  244  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  32.68 
 
 		 1096 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  32.21 
 
 		 1222 aa  240  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  31.91 
 
 		 1194 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 1414 aa  236  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  35.81 
 
 		 993 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  29.86 
 
 		 1016 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.52 
 
 		 1068 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  30.81 
 
 		 1517 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 1091 aa  227  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  31.63 
 
 		 1431 aa  227  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  31.8 
 
 		 956 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  32.1 
 
 		 522 aa  226  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  30.72 
 
 		 1111 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  30.87 
 
 		 663 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 1069 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  29.34 
 
 		 902 aa  223  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  30.43 
 
 		 964 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.58 
 
 		 977 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.07 
 
 		 1848 aa  220  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 1071 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  31.21 
 
 		 1250 aa  220  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  31.06 
 
 		 860 aa  218  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  30.17 
 
 		 1125 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.96 
 
 		 1068 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  30.69 
 
 		 995 aa  217  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  28.97 
 
 		 1832 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0976773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 1082 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  30.56 
 
 		 1084 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  30.56 
 
 		 1084 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  31.77 
 
 		 1062 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  30.52 
 
 		 918 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  30.52 
 
 		 918 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  30.52 
 
 		 918 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  30.52 
 
 		 918 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 		 918 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  30.84 
 
 		 1040 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 1055 aa  210  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  30.52 
 
 		 918 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  30.86 
 
 		 918 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 		 1050 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  30.78 
 
 		 918 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  29.78 
 
 		 918 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.91 
 
 		 918 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 918 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 1028 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  31.44 
 
 		 1048 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  29.84 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  29.92 
 
 		 959 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.21 
 
 		 1064 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 1068 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  29.93 
 
 		 1769 aa  206  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  30.35 
 
 		 1087 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 1074 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.22 
 
 		 1407 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  30.23 
 
 		 1519 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  31.13 
 
 		 985 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.4 
 
 		 1064 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  30.69 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 		 982 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.19 
 
 		 1091 aa  203  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.36 
 
 		 1354 aa  203  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.59 
 
 		 1064 aa  203  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  31.67 
 
 		 1161 aa  203  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.23 
 
 		 1086 aa  203  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  29.72 
 
 		 1077 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  28.77 
 
 		 1259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 		 1171 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  28.71 
 
 		 1003 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  30.81 
 
 		 1013 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  28.95 
 
 		 970 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  29.55 
 
 		 1181 aa  201  3e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 1068 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  29.03 
 
 		 1064 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 1129 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 1118 aa  199  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  28.93 
 
 		 1394 aa  199  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.18 
 
 		 1175 aa  199  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.68 
 
 		 1134 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  28.46 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  28.65 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  28.46 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  28.46 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 		 1021 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 1112 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  28.65 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>