More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35059 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  100 
 
 
688 aa  1406    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  39.16 
 
 
821 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  37.66 
 
 
821 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  37.55 
 
 
818 aa  334  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  37.62 
 
 
833 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  35.14 
 
 
809 aa  324  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  34.12 
 
 
983 aa  324  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  36.13 
 
 
545 aa  321  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  32.56 
 
 
1011 aa  294  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  35.02 
 
 
975 aa  286  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.14 
 
 
1193 aa  249  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  28.97 
 
 
1067 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  31.92 
 
 
1354 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  29.89 
 
 
1111 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  31.1 
 
 
970 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  29.75 
 
 
956 aa  204  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  29.8 
 
 
711 aa  204  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  28.19 
 
 
1016 aa  203  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  30.47 
 
 
1517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
1112 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  29.14 
 
 
1088 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  31.63 
 
 
993 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 
1108 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.34 
 
 
1082 aa  194  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  30.41 
 
 
509 aa  193  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  29.07 
 
 
1096 aa  193  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  28.74 
 
 
1087 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  28.82 
 
 
1073 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.71 
 
 
1072 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  31.18 
 
 
902 aa  191  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  28.21 
 
 
589 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.95 
 
 
918 aa  191  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  30.54 
 
 
1284 aa  190  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  27.09 
 
 
1125 aa  190  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  29.54 
 
 
1082 aa  190  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  29.54 
 
 
1082 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  28.15 
 
 
1431 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  27.72 
 
 
1832 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0976773 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  29.23 
 
 
1259 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  29.95 
 
 
918 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  29.95 
 
 
918 aa  188  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  30.13 
 
 
522 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  30.38 
 
 
1222 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  28.65 
 
 
1414 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.79 
 
 
1070 aa  187  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  28.65 
 
 
1070 aa  187  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  31.19 
 
 
958 aa  187  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.94 
 
 
1078 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  32.5 
 
 
903 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  29.58 
 
 
918 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
1073 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  29.58 
 
 
918 aa  185  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01650  DNA dependent ATPase, putative  28.21 
 
 
1036 aa  185  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  29.58 
 
 
918 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  29.58 
 
 
918 aa  185  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  28.91 
 
 
1023 aa  185  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.31 
 
 
1102 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
1104 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.92 
 
 
1031 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 
848 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
1105 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
1073 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.8 
 
 
1134 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
1073 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  27.96 
 
 
1904 aa  183  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  28.22 
 
 
1084 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  28.22 
 
 
1084 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  28.21 
 
 
1407 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  25.77 
 
 
1130 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
1129 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  26.26 
 
 
1194 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.57 
 
 
1025 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  27.91 
 
 
995 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.95 
 
 
959 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  28.13 
 
 
1031 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
1112 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31 
 
 
1086 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  28.47 
 
 
1077 aa  181  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
1073 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  29.46 
 
 
990 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.02 
 
 
621 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  29.59 
 
 
1120 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
1050 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  31.25 
 
 
666 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  28.27 
 
 
1164 aa  181  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
1055 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  32.46 
 
 
896 aa  180  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
1105 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.54 
 
 
988 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
1449 aa  180  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  28.1 
 
 
1566 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 
1074 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  29.9 
 
 
1181 aa  179  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  29.92 
 
 
1120 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.1 
 
 
977 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.6 
 
 
1381 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 
1069 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.79 
 
 
1080 aa  178  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  29.48 
 
 
1107 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
876 aa  178  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>