More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16586 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  100 
 
 
983 aa  2031    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  54.16 
 
 
545 aa  594  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  51.06 
 
 
821 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  47.06 
 
 
833 aa  536  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  46.57 
 
 
818 aa  523  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  45.45 
 
 
1011 aa  449  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  36.72 
 
 
809 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  38.18 
 
 
821 aa  345  4e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  34.12 
 
 
688 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  36.56 
 
 
975 aa  325  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  32.88 
 
 
711 aa  271  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  37.89 
 
 
993 aa  266  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  30.91 
 
 
1067 aa  254  7e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  29.64 
 
 
1016 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  29.8 
 
 
1193 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  31.46 
 
 
1431 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  29.47 
 
 
902 aa  239  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  30.8 
 
 
1096 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  30.99 
 
 
1222 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  33.15 
 
 
522 aa  231  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  31.02 
 
 
1414 aa  231  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  32.46 
 
 
663 aa  230  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  32.98 
 
 
1848 aa  229  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
1082 aa  224  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  30.77 
 
 
1901 aa  223  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  29.87 
 
 
956 aa  223  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  29.27 
 
 
970 aa  223  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.47 
 
 
977 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  28.15 
 
 
1517 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  28.98 
 
 
1259 aa  221  7.999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.83 
 
 
1087 aa  220  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  28.53 
 
 
1558 aa  219  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 
1112 aa  219  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  30.78 
 
 
1194 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  28.87 
 
 
1519 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  30.13 
 
 
589 aa  218  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  30.41 
 
 
1769 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  30.72 
 
 
1111 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  29.54 
 
 
1023 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  30.34 
 
 
995 aa  216  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  30.8 
 
 
1125 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  29.83 
 
 
918 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.42 
 
 
1068 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  30.24 
 
 
1031 aa  214  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  28.22 
 
 
1407 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  30.74 
 
 
1134 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30.97 
 
 
1086 aa  213  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
1069 aa  213  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  29.65 
 
 
918 aa  213  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  29.65 
 
 
918 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  29.8 
 
 
918 aa  213  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  29.65 
 
 
918 aa  213  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  29.8 
 
 
918 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.1 
 
 
1068 aa  211  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
892 aa  211  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  29.24 
 
 
964 aa  210  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  26.23 
 
 
1832 aa  210  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0976773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.62 
 
 
918 aa  210  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  30.04 
 
 
777 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  31.19 
 
 
1048 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
1139 aa  210  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.45 
 
 
1181 aa  209  2e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  29.13 
 
 
959 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
1055 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
933 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  28.97 
 
 
1566 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  29.58 
 
 
991 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  30.24 
 
 
1077 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  30.17 
 
 
1178 aa  208  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  27.66 
 
 
1003 aa  207  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  30.06 
 
 
663 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
617 aa  207  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
918 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  30.06 
 
 
773 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
1171 aa  206  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  28.75 
 
 
1904 aa  206  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
1021 aa  205  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
1118 aa  204  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 
1091 aa  204  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 
1068 aa  204  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  29.5 
 
 
924 aa  204  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
918 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  28.1 
 
 
1250 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
982 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.39 
 
 
918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
925 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  29.07 
 
 
918 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  29.25 
 
 
1161 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
966 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  30.18 
 
 
903 aa  201  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  30.66 
 
 
860 aa  201  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
1050 aa  201  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
1069 aa  201  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.41 
 
 
985 aa  201  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  29.84 
 
 
1078 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.94 
 
 
1082 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
1110 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  27.57 
 
 
1071 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  28.54 
 
 
509 aa  198  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.13 
 
 
1082 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>