More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37662 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  100 
 
 
589 aa  1214    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  46.93 
 
 
956 aa  466  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  44.56 
 
 
970 aa  464  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  46.87 
 
 
1096 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  44.75 
 
 
1222 aa  447  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  47.84 
 
 
509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  44.84 
 
 
1431 aa  440  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  44.32 
 
 
1111 aa  438  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  45.26 
 
 
1407 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  43.91 
 
 
1558 aa  434  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  43.03 
 
 
1259 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  44.55 
 
 
1023 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  43.28 
 
 
995 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  42.69 
 
 
1566 aa  415  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  44.1 
 
 
860 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  42.71 
 
 
479 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  41.09 
 
 
522 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  37.84 
 
 
1414 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  40.18 
 
 
1519 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  41.15 
 
 
495 aa  353  5e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  37.86 
 
 
1517 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  39.96 
 
 
663 aa  339  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  52.96 
 
 
868 aa  335  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  52.6 
 
 
926 aa  329  7e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  42.95 
 
 
1156 aa  323  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.91 
 
 
1326 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  34.76 
 
 
1067 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  33.56 
 
 
1443 aa  298  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  35.47 
 
 
939 aa  291  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  32.85 
 
 
1107 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
1069 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.2 
 
 
1071 aa  287  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.78 
 
 
1901 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  35.4 
 
 
1093 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 
1112 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
1068 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.2 
 
 
1068 aa  280  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
1055 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  34.22 
 
 
1193 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.67 
 
 
1062 aa  276  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  34.73 
 
 
1181 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.14 
 
 
1848 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.47 
 
 
1068 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
1091 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.99 
 
 
1904 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.26 
 
 
1077 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
1090 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  34.37 
 
 
1087 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  45 
 
 
832 aa  267  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  34.11 
 
 
609 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
1021 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.35 
 
 
1125 aa  264  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  33.14 
 
 
1134 aa  263  8.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  33.27 
 
 
777 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  32.06 
 
 
711 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  32.88 
 
 
1003 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
1139 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32.3 
 
 
1769 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.31 
 
 
1088 aa  258  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.31 
 
 
1088 aa  257  5e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34 
 
 
876 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.8 
 
 
663 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.27 
 
 
621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
918 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
1110 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
982 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  41.72 
 
 
1557 aa  254  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 
1068 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  32.61 
 
 
959 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  32.37 
 
 
918 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.22 
 
 
985 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
925 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  35 
 
 
773 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
1171 aa  252  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  32.18 
 
 
918 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 
918 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
1104 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.85 
 
 
1031 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  33.2 
 
 
924 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
1082 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  32.33 
 
 
1080 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  32.95 
 
 
918 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  32.95 
 
 
918 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.14 
 
 
918 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  32.16 
 
 
918 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  32.16 
 
 
918 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  31.98 
 
 
918 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.73 
 
 
914 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  32.16 
 
 
918 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
933 aa  250  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  39.18 
 
 
1698 aa  249  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  33.72 
 
 
918 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  34.07 
 
 
1064 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  32.58 
 
 
902 aa  249  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
1112 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  41.82 
 
 
1246 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  32.27 
 
 
648 aa  246  8e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  32.5 
 
 
1073 aa  246  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  30.04 
 
 
958 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.73 
 
 
1250 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>