More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01070 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  43.09 
 
 		 1517 aa  788    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  100 
 
 		 1519 aa  3155    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 1414 aa  932    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  42.36 
 
 		 1431 aa  455  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  44.93 
 
 		 956 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  44.57 
 
 		 1111 aa  443  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  44.59 
 
 		 970 aa  442  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  40.17 
 
 		 1222 aa  443  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  43.63 
 
 		 1407 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  41.7 
 
 		 995 aa  417  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  45.4 
 
 		 1096 aa  415  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  41.8 
 
 		 1023 aa  416  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  43.39 
 
 		 1566 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  38.58 
 
 		 663 aa  402  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  42.28 
 
 		 1558 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  41.4 
 
 		 860 aa  399  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  46.35 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  40.76 
 
 		 1259 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  34.91 
 
 		 1443 aa  380  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.89 
 
 		 1326 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  39.81 
 
 		 522 aa  370  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  40.18 
 
 		 589 aa  363  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  41.23 
 
 		 495 aa  357  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  39.5 
 
 		 531 aa  339  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  38.82 
 
 		 509 aa  329  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  39.68 
 
 		 1156 aa  326  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  32.6 
 
 		 939 aa  267  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  32.24 
 
 		 1093 aa  259  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 1112 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  32.19 
 
 		 1193 aa  246  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.27 
 
 		 1107 aa  242  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.48 
 
 		 663 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.33 
 
 		 773 aa  240  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  32.46 
 
 		 1386 aa  241  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  31.12 
 
 		 1067 aa  240  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  32.46 
 
 		 1362 aa  239  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 1108 aa  239  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  31.3 
 
 		 1769 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  33.06 
 
 		 1077 aa  238  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  39.25 
 
 		 1269 aa  237  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.07 
 
 		 1904 aa  236  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  34.81 
 
 		 991 aa  236  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  38.39 
 
 		 1612 aa  234  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  32.36 
 
 		 609 aa  232  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.12 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.86 
 
 		 1848 aa  230  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.98 
 
 		 1091 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.02 
 
 		 1178 aa  229  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 		 1120 aa  229  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.36 
 
 		 1082 aa  229  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.49 
 
 		 1143 aa  229  5.0000000000000005e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 		 1105 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  32.2 
 
 		 648 aa  228  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.68 
 
 		 666 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 		 1449 aa  226  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  28.6 
 
 		 818 aa  227  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  28.66 
 
 		 1163 aa  227  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 848 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  30.69 
 
 		 1096 aa  226  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 		 1105 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 1091 aa  225  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.86 
 
 		 1068 aa  224  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  37.65 
 
 		 1557 aa  224  9e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  33.62 
 
 		 1100 aa  224  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  32.46 
 
 		 1032 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  31.2 
 
 		 1070 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  29.36 
 
 		 1025 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 1104 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1088 aa  222  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 		 1112 aa  223  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  38.22 
 
 		 1698 aa  222  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1088 aa  222  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.68 
 
 		 1087 aa  222  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 1403 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 		 1139 aa  221  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  30.27 
 
 		 1159 aa  221  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  31.91 
 
 		 1154 aa  221  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.57 
 
 		 1171 aa  221  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.59 
 
 		 1082 aa  221  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 1118 aa  221  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.86 
 
 		 1071 aa  221  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  30.31 
 
 		 1125 aa  221  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  32.07 
 
 		 918 aa  220  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.35 
 
 		 1134 aa  220  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 982 aa  220  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  32 
 
 		 980 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.53 
 
 		 1068 aa  220  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  31.14 
 
 		 711 aa  220  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  31.73 
 
 		 903 aa  220  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.04 
 
 		 988 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32 
 
 		 1088 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 918 aa  219  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  32.2 
 
 		 1112 aa  219  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  31.17 
 
 		 985 aa  218  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  33.26 
 
 		 1437 aa  218  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  31.06 
 
 		 958 aa  219  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.44 
 
 		 1029 aa  218  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31 
 
 		 1080 aa  218  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  30.7 
 
 		 1901 aa  218  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.35 
 
 		 1084 aa  218  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>