More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04710 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  38.43 
 
 		 1904 aa  1226    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  40.18 
 
 		 1769 aa  700    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  100 
 
 		 1848 aa  3796    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  37.26 
 
 		 1901 aa  1182    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  40.36 
 
 		 535 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.61 
 
 		 1087 aa  348  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  38.87 
 
 		 1181 aa  342  4e-92  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.25 
 
 		 1125 aa  340  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37 
 
 		 1139 aa  336  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.15 
 
 		 1077 aa  327  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  35.99 
 
 		 1067 aa  322  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  34.41 
 
 		 1193 aa  322  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 		 1112 aa  321  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 		 1082 aa  319  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 		 1066 aa  314  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.18 
 
 		 977 aa  311  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  37.55 
 
 		 1031 aa  310  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.06 
 
 		 1082 aa  310  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 982 aa  309  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  35.94 
 
 		 995 aa  307  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  35.65 
 
 		 1023 aa  306  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  36.87 
 
 		 1068 aa  306  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  34.63 
 
 		 964 aa  305  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.28 
 
 		 1021 aa  305  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  34.56 
 
 		 1064 aa  304  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  34.39 
 
 		 1064 aa  304  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  34.39 
 
 		 1064 aa  303  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  34.21 
 
 		 1064 aa  303  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  34.39 
 
 		 1064 aa  301  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  34.39 
 
 		 1064 aa  302  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  34.39 
 
 		 1064 aa  301  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  34.56 
 
 		 1064 aa  302  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 		 1069 aa  301  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  34.56 
 
 		 1064 aa  301  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  34.71 
 
 		 1259 aa  301  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  35.85 
 
 		 1178 aa  300  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 		 1069 aa  300  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  34.79 
 
 		 1068 aa  298  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  34.87 
 
 		 1222 aa  298  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 		 1055 aa  298  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 1068 aa  298  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.19 
 
 		 1068 aa  296  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 		 1073 aa  296  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.3 
 
 		 1102 aa  295  8e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  32.96 
 
 		 959 aa  295  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 		 1073 aa  294  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1558 aa  294  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.17 
 
 		 1091 aa  294  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 1091 aa  294  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  36.33 
 
 		 1112 aa  294  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.54 
 
 		 1071 aa  294  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 		 1073 aa  293  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  34.06 
 
 		 956 aa  293  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.43 
 
 		 1250 aa  292  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  34.16 
 
 		 711 aa  292  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  34.99 
 
 		 1407 aa  292  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  33.7 
 
 		 1003 aa  291  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 1073 aa  291  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  34.84 
 
 		 1073 aa  290  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  34.08 
 
 		 1161 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.07 
 
 		 1134 aa  289  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  33.03 
 
 		 1084 aa  289  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.85 
 
 		 1084 aa  288  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  34.21 
 
 		 1013 aa  288  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 1110 aa  287  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.4 
 
 		 1566 aa  287  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 1090 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.03 
 
 		 1084 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 		 1261 aa  286  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  33.45 
 
 		 1111 aa  285  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  33.76 
 
 		 1150 aa  285  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  34.13 
 
 		 970 aa  284  9e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  35.42 
 
 		 1070 aa  284  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  34.43 
 
 		 1096 aa  284  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1362 aa  284  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  34.51 
 
 		 589 aa  283  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1088 aa  283  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.47 
 
 		 1088 aa  283  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.58 
 
 		 1080 aa  283  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  32.26 
 
 		 1032 aa  282  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 		 1152 aa  282  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 		 1129 aa  282  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1155 aa  282  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  33.21 
 
 		 1386 aa  282  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  33.53 
 
 		 1431 aa  281  9e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  34.15 
 
 		 1072 aa  281  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  33.64 
 
 		 1078 aa  280  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  34.21 
 
 		 1082 aa  280  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 1113 aa  280  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  34.18 
 
 		 1113 aa  280  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  33.86 
 
 		 1082 aa  279  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  36.25 
 
 		 522 aa  278  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  34.38 
 
 		 1062 aa  278  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.89 
 
 		 1031 aa  278  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 918 aa  278  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  33.39 
 
 		 918 aa  278  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  33.94 
 
 		 896 aa  278  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  34.64 
 
 		 985 aa  278  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  34.08 
 
 		 1070 aa  278  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 1089 aa  278  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>