More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47011 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  42.8 
 
 		 1111 aa  721    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  42.62 
 
 		 860 aa  637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  40.41 
 
 		 1023 aa  688    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  41.92 
 
 		 1096 aa  699    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  47.15 
 
 		 956 aa  827    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  51.74 
 
 		 970 aa  971    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  43.22 
 
 		 1222 aa  700    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  100 
 
 		 1431 aa  2955    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  47.84 
 
 		 995 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  45.58 
 
 		 1407 aa  473  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  46.86 
 
 		 522 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  42.86 
 
 		 1566 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  45.14 
 
 		 1558 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  43.2 
 
 		 1519 aa  457  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  45.15 
 
 		 1259 aa  456  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 1414 aa  452  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.93 
 
 		 589 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  42.3 
 
 		 509 aa  412  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  41.91 
 
 		 1517 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  44.51 
 
 		 1156 aa  386  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  43.04 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  41.55 
 
 		 663 aa  370  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  38.87 
 
 		 1443 aa  361  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  42.62 
 
 		 495 aa  352  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  33.23 
 
 		 1326 aa  304  7.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  36.65 
 
 		 1107 aa  303  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  38.13 
 
 		 1077 aa  299  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 		 1068 aa  298  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 1112 aa  297  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.81 
 
 		 777 aa  294  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.65 
 
 		 1068 aa  292  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  34.88 
 
 		 1068 aa  291  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  35.25 
 
 		 1362 aa  289  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  35.57 
 
 		 648 aa  288  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.44 
 
 		 1087 aa  288  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  34.85 
 
 		 1386 aa  288  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 		 1091 aa  288  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 1069 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.36 
 
 		 939 aa  284  7.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  34.61 
 
 		 609 aa  284  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  34.03 
 
 		 1354 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.3 
 
 		 1071 aa  282  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.68 
 
 		 1904 aa  281  9e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  36.94 
 
 		 773 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.37 
 
 		 1080 aa  280  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 1108 aa  280  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 		 1082 aa  279  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.83 
 
 		 1901 aa  278  7e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  37.63 
 
 		 663 aa  278  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 		 876 aa  277  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.72 
 
 		 1848 aa  277  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.56 
 
 		 1091 aa  277  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  34.04 
 
 		 1125 aa  277  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  33.53 
 
 		 1067 aa  276  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  35.15 
 
 		 1070 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  30.71 
 
 		 1193 aa  276  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  35.16 
 
 		 1072 aa  276  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.08 
 
 		 1139 aa  273  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  32.38 
 
 		 1093 aa  273  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  34.07 
 
 		 1178 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  33.13 
 
 		 1769 aa  272  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  35.23 
 
 		 1082 aa  271  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  35.89 
 
 		 1105 aa  271  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 		 1104 aa  271  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 		 1171 aa  271  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.58 
 
 		 1062 aa  270  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  34.82 
 
 		 711 aa  270  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1120 aa  269  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 		 1105 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  35.48 
 
 		 666 aa  269  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  34.07 
 
 		 1154 aa  268  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 		 1112 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  34.52 
 
 		 980 aa  268  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  34.77 
 
 		 1134 aa  268  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 		 918 aa  268  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 1449 aa  268  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 		 1089 aa  267  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  35.01 
 
 		 918 aa  267  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  33.82 
 
 		 1078 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  33.26 
 
 		 1163 aa  267  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 918 aa  267  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  35.03 
 
 		 1082 aa  267  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  34.24 
 
 		 918 aa  266  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  34.24 
 
 		 918 aa  266  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  32.79 
 
 		 1003 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  35.16 
 
 		 1082 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  34.38 
 
 		 918 aa  266  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 982 aa  266  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  34.11 
 
 		 1031 aa  265  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  34.38 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1088 aa  265  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  33.33 
 
 		 1084 aa  265  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  35.37 
 
 		 991 aa  265  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1088 aa  265  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  34.38 
 
 		 918 aa  265  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  33.63 
 
 		 1113 aa  265  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  34.38 
 
 		 918 aa  265  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 1113 aa  265  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.26 
 
 		 1084 aa  264  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  35.23 
 
 		 872 aa  264  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>