More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16250 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  100 
 
 		 1156 aa  2378    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  35.74 
 
 		 1407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  36.34 
 
 		 1558 aa  462  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  35.4 
 
 		 995 aa  459  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  38.39 
 
 		 1259 aa  454  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.44 
 
 		 1566 aa  456  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  44.51 
 
 		 1431 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  41.36 
 
 		 956 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  44.21 
 
 		 1222 aa  409  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  43.55 
 
 		 1111 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  43.06 
 
 		 1096 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  42.74 
 
 		 1023 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  41.41 
 
 		 970 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  40.98 
 
 		 860 aa  348  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  41.09 
 
 		 509 aa  348  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  43.07 
 
 		 589 aa  347  6e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  39.52 
 
 		 1519 aa  341  4e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 1414 aa  338  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  39.49 
 
 		 663 aa  330  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  36.2 
 
 		 1517 aa  313  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  38.33 
 
 		 522 aa  311  5.9999999999999995e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  38.2 
 
 		 479 aa  298  5e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  37.6 
 
 		 1443 aa  279  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  35.91 
 
 		 495 aa  278  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  35.89 
 
 		 1326 aa  272  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  38.2 
 
 		 832 aa  256  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  46.43 
 
 		 868 aa  254  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  40.88 
 
 		 926 aa  241  5e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  40.37 
 
 		 1698 aa  241  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.6 
 
 		 1848 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.35 
 
 		 1077 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.27 
 
 		 1107 aa  238  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 		 1246 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  40.85 
 
 		 1053 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  39.1 
 
 		 1557 aa  235  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  33.88 
 
 		 1612 aa  230  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  30.06 
 
 		 1067 aa  230  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  31.92 
 
 		 1093 aa  230  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 		 1082 aa  229  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.77 
 
 		 1071 aa  228  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 1031 aa  228  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 1091 aa  227  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  32.31 
 
 		 1125 aa  227  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 1112 aa  226  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  36.2 
 
 		 1269 aa  226  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.75 
 
 		 1068 aa  226  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 1139 aa  225  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 1765 aa  224  8e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  31.17 
 
 		 1901 aa  224  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 777 aa  222  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.97 
 
 		 1068 aa  221  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.82 
 
 		 991 aa  221  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  27.89 
 
 		 1193 aa  221  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.24 
 
 		 1087 aa  220  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.44 
 
 		 1181 aa  220  1e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1088 aa  219  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  31.7 
 
 		 939 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32.92 
 
 		 1769 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  28.83 
 
 		 1904 aa  218  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 1112 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 1069 aa  218  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1088 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34 
 
 		 1091 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  32.2 
 
 		 1082 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  32.2 
 
 		 1082 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  28.95 
 
 		 711 aa  215  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  31.32 
 
 		 1161 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 1068 aa  214  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.4 
 
 		 1062 aa  214  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.14 
 
 		 1080 aa  214  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  30.93 
 
 		 1070 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  43.43 
 
 		 248 aa  214  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  30.68 
 
 		 648 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.62 
 
 		 1134 aa  213  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 1155 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  31.93 
 
 		 1088 aa  213  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 		 1104 aa  212  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 1120 aa  212  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  31.97 
 
 		 531 aa  213  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 876 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  31.97 
 
 		 1150 aa  211  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.42 
 
 		 1362 aa  211  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  31.57 
 
 		 1082 aa  211  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  31.15 
 
 		 1178 aa  209  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.76 
 
 		 1026 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  31.56 
 
 		 1100 aa  209  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.43 
 
 		 1086 aa  208  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.8 
 
 		 621 aa  208  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.02 
 
 		 1250 aa  208  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  31.09 
 
 		 985 aa  207  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1047 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  30.77 
 
 		 1047 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  30.13 
 
 		 1386 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 1449 aa  206  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 1021 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 1068 aa  206  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  32.46 
 
 		 1070 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  29.54 
 
 		 1120 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 1113 aa  206  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  30.47 
 
 		 1072 aa  206  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>