More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65204 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  100 
 
 
1269 aa  2634    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  54.13 
 
 
1612 aa  1118    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  50.86 
 
 
1765 aa  938    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  35.38 
 
 
1698 aa  445  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  43.9 
 
 
1557 aa  322  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  41.43 
 
 
1053 aa  303  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  37.15 
 
 
1246 aa  301  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4016  predicted protein  50.2 
 
 
248 aa  270  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  34.17 
 
 
1111 aa  265  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  39.76 
 
 
1566 aa  261  7e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  40.51 
 
 
956 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  42.38 
 
 
995 aa  258  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  33.9 
 
 
1431 aa  257  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  38.53 
 
 
1222 aa  256  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  38.51 
 
 
1096 aa  254  8.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.25 
 
 
1407 aa  251  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  38.44 
 
 
1558 aa  245  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  39.14 
 
 
1023 aa  244  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  39.47 
 
 
970 aa  243  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  39.13 
 
 
1259 aa  240  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  39.25 
 
 
1519 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  39.13 
 
 
589 aa  234  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  31.66 
 
 
926 aa  233  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  39.4 
 
 
509 aa  232  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  40.28 
 
 
868 aa  230  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  40.86 
 
 
860 aa  222  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  38.01 
 
 
1414 aa  218  5.9999999999999996e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 
832 aa  216  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.96 
 
 
1087 aa  211  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  37.19 
 
 
522 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  31.57 
 
 
1156 aa  206  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
1112 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  36.68 
 
 
479 aa  198  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.53 
 
 
1078 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  34.67 
 
 
1901 aa  194  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  35.9 
 
 
1517 aa  193  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  35.78 
 
 
1093 aa  192  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  35.78 
 
 
1077 aa  191  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  31.54 
 
 
621 aa  190  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  34.69 
 
 
1107 aa  189  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
1048 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.73 
 
 
1125 aa  188  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.92 
 
 
1082 aa  188  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
950 aa  188  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
1108 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.09 
 
 
1134 aa  187  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
1112 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
1129 aa  186  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 
1120 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  33.85 
 
 
1161 aa  185  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  35.71 
 
 
1080 aa  184  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  33.77 
 
 
1072 aa  184  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
1105 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
1047 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  33.96 
 
 
959 aa  183  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.15 
 
 
666 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  32.09 
 
 
1047 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
1105 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
918 aa  183  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
1082 aa  183  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
1029 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
1028 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
1055 aa  181  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.12 
 
 
777 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  34.98 
 
 
1141 aa  181  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  36.16 
 
 
1326 aa  181  9e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  33.12 
 
 
773 aa  181  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1110 aa  180  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.76 
 
 
1062 aa  180  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 
1091 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
1403 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  36.26 
 
 
872 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
1089 aa  179  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  35.16 
 
 
939 aa  178  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.41 
 
 
1178 aa  178  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.03 
 
 
1068 aa  178  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  32.64 
 
 
964 aa  178  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
1090 aa  177  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
1069 aa  177  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
982 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  33.12 
 
 
663 aa  177  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  32.69 
 
 
1127 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.29 
 
 
1071 aa  177  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  33.84 
 
 
918 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.48 
 
 
918 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  31.44 
 
 
990 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.48 
 
 
914 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  33.84 
 
 
918 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.44 
 
 
1084 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  29.57 
 
 
980 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  33.54 
 
 
918 aa  175  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  33.54 
 
 
918 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  33.54 
 
 
918 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.54 
 
 
918 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
1104 aa  175  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  33.54 
 
 
918 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.23 
 
 
1026 aa  174  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  33.54 
 
 
918 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.02 
 
 
977 aa  174  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.03 
 
 
1102 aa  174  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>