More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02890 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  57.8 
 
 		 833 aa  914    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  62.28 
 
 		 821 aa  866    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  100 
 
 		 818 aa  1698    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  46.57 
 
 		 983 aa  519  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  47.3 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  43.58 
 
 		 1011 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  41.83 
 
 		 809 aa  415  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  41.42 
 
 		 821 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  40.71 
 
 		 975 aa  364  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  37.55 
 
 		 688 aa  334  3e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  41.97 
 
 		 993 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  32.5 
 
 		 1193 aa  271  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  33.07 
 
 		 711 aa  265  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  34.52 
 
 		 1431 aa  260  8e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  33.01 
 
 		 1222 aa  249  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  34.89 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  30.62 
 
 		 1067 aa  248  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  32.94 
 
 		 1259 aa  240  9e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  32.49 
 
 		 1096 aa  240  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  30.57 
 
 		 663 aa  239  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  31.51 
 
 		 956 aa  239  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  32.94 
 
 		 1407 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  27.27 
 
 		 1832 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0976773 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  30.51 
 
 		 1111 aa  232  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  30.78 
 
 		 1566 aa  232  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  31.14 
 
 		 1023 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 1414 aa  231  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  29.63 
 
 		 1016 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  32.64 
 
 		 509 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  28.31 
 
 		 1519 aa  227  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  31.37 
 
 		 995 aa  226  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1558 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 1112 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 1082 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  31.65 
 
 		 860 aa  217  9e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  29.21 
 
 		 1517 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.37 
 
 		 1848 aa  214  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  30.55 
 
 		 970 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.58 
 
 		 1086 aa  212  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  32.69 
 
 		 479 aa  211  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  29.8 
 
 		 589 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  31.56 
 
 		 1077 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  28.93 
 
 		 964 aa  208  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 1250 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 950 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  31.09 
 
 		 1354 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  29.09 
 
 		 1048 aa  207  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 933 aa  207  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.43 
 
 		 1134 aa  207  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.44 
 
 		 977 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.43 
 
 		 1087 aa  205  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.17 
 
 		 959 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 1091 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 1050 aa  204  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  30.29 
 
 		 535 aa  204  8e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  30.29 
 
 		 891 aa  204  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  31.39 
 
 		 1326 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  28.97 
 
 		 1194 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.58 
 
 		 1068 aa  202  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 		 966 aa  202  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  31.29 
 
 		 985 aa  201  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 1021 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  28.89 
 
 		 1068 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.32 
 
 		 621 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 		 1152 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 1112 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 1066 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  28.78 
 
 		 1769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  30.93 
 
 		 1031 aa  198  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.55 
 
 		 1062 aa  198  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  30.04 
 
 		 1185 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  27.29 
 
 		 902 aa  197  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 1074 aa  197  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  30.07 
 
 		 1161 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 1129 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 1055 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 		 918 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  28.55 
 
 		 1071 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 1028 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  28.62 
 
 		 1093 aa  195  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  27.52 
 
 		 1901 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 1069 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.93 
 
 		 1072 aa  194  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 1069 aa  194  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.51 
 
 		 1078 aa  194  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 617 aa  193  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  29.85 
 
 		 924 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.03 
 
 		 1064 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  29.54 
 
 		 1443 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  28.36 
 
 		 1064 aa  191  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 892 aa  191  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  28.44 
 
 		 1064 aa  190  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  27.41 
 
 		 1175 aa  190  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  29.71 
 
 		 1125 aa  190  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  28.52 
 
 		 1003 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  30.63 
 
 		 903 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  28.52 
 
 		 1064 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  28.52 
 
 		 1064 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  28.52 
 
 		 1064 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  28.52 
 
 		 1064 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>