More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53653 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  59.6 
 
 		 833 aa  927    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  100 
 
 		 821 aa  1697    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  62.57 
 
 		 818 aa  874    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  50.71 
 
 		 983 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  47.03 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  44.93 
 
 		 1011 aa  432  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  41.62 
 
 		 809 aa  416  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  38.47 
 
 		 821 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  38.08 
 
 		 993 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  36.08 
 
 		 975 aa  343  9e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  37.66 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  33.17 
 
 		 1067 aa  291  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  34.31 
 
 		 711 aa  284  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  32.21 
 
 		 1193 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  33.33 
 
 		 1222 aa  254  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 1414 aa  243  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 1112 aa  240  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  32.15 
 
 		 1431 aa  237  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  31.03 
 
 		 1517 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  31.66 
 
 		 509 aa  234  6e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  27.99 
 
 		 1832 aa  234  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0976773 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  29.98 
 
 		 1096 aa  233  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  31.6 
 
 		 663 aa  231  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  32.24 
 
 		 995 aa  230  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  31.05 
 
 		 1111 aa  230  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  29.32 
 
 		 1016 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  32.06 
 
 		 956 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  31.05 
 
 		 1023 aa  228  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  30.71 
 
 		 1769 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  30.95 
 
 		 1326 aa  223  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.61 
 
 		 959 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 		 1082 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 		 1021 aa  220  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  31.98 
 
 		 522 aa  220  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.11 
 
 		 1086 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  30.59 
 
 		 1259 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  30.22 
 
 		 1519 aa  219  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  31.78 
 
 		 1848 aa  217  7e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1558 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  29.29 
 
 		 589 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  29.41 
 
 		 1077 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.55 
 
 		 977 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  28.92 
 
 		 970 aa  215  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.07 
 
 		 1031 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  30.76 
 
 		 1069 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 1055 aa  214  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.08 
 
 		 1250 aa  214  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  30 
 
 		 1194 aa  213  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 		 966 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.1 
 
 		 1407 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  29.09 
 
 		 1901 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  27.98 
 
 		 902 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  30.84 
 
 		 1161 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.1 
 
 		 1134 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  29.1 
 
 		 1566 aa  210  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.94 
 
 		 1087 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 		 950 aa  209  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  29.09 
 
 		 891 aa  208  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.05 
 
 		 1078 aa  208  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 1112 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  29.83 
 
 		 860 aa  207  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.07 
 
 		 1068 aa  207  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  28 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  30.05 
 
 		 1072 aa  207  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 1073 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  27.36 
 
 		 898 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  29.77 
 
 		 1904 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  31.15 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  29.47 
 
 		 964 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 1028 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  30.68 
 
 		 1088 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  28.95 
 
 		 1064 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 1073 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  31.69 
 
 		 1070 aa  204  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 1073 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 1139 aa  204  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 617 aa  204  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 1073 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  29.28 
 
 		 903 aa  204  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  28.73 
 
 		 1048 aa  203  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 1066 aa  203  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30 
 
 		 914 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.57 
 
 		 1062 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.62 
 
 		 1125 aa  203  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  29.82 
 
 		 918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.72 
 
 		 1068 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.08 
 
 		 1064 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  28.55 
 
 		 1050 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.03 
 
 		 1064 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 		 1068 aa  200  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  30.83 
 
 		 872 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  29.68 
 
 		 1130 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  28.6 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  28.77 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  28.77 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 1155 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  28.77 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.87 
 
 		 1102 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  28.77 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 1152 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>