More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_15102 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_15102  helicase  100 
 
 
809 aa  1659    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  36.38 
 
 
1011 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  41.62 
 
 
821 aa  416  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  41.83 
 
 
818 aa  416  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  39.45 
 
 
833 aa  402  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  40.29 
 
 
545 aa  396  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  36.49 
 
 
983 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  36.15 
 
 
821 aa  340  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  34.79 
 
 
975 aa  329  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  35.14 
 
 
688 aa  324  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  39.2 
 
 
993 aa  303  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  29.82 
 
 
1023 aa  241  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  28.07 
 
 
1193 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  30.44 
 
 
1111 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  29.29 
 
 
956 aa  230  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  30.52 
 
 
1904 aa  227  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  30.39 
 
 
1517 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  29.44 
 
 
1259 aa  226  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  29.35 
 
 
1067 aa  226  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  29.27 
 
 
1096 aa  226  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  29.27 
 
 
589 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  30.14 
 
 
1222 aa  224  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  29.82 
 
 
995 aa  223  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  28.32 
 
 
711 aa  223  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  29.49 
 
 
1407 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  31.72 
 
 
522 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
1108 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  27.97 
 
 
663 aa  221  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.67 
 
 
1354 aa  221  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  25.71 
 
 
988 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.26 
 
 
1031 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  29.45 
 
 
970 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
876 aa  218  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  30.72 
 
 
918 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  30.25 
 
 
509 aa  214  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  30.72 
 
 
918 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  31.61 
 
 
479 aa  214  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
918 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  29.7 
 
 
1769 aa  213  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.75 
 
 
1175 aa  213  9e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  28.83 
 
 
1558 aa  213  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  24.72 
 
 
898 aa  213  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  30.53 
 
 
918 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 
918 aa  213  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  30.53 
 
 
918 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.89 
 
 
1125 aa  212  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  30.53 
 
 
918 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  30.33 
 
 
1032 aa  212  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  30.53 
 
 
918 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  29.42 
 
 
1566 aa  212  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  29.58 
 
 
1431 aa  211  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  30.33 
 
 
918 aa  211  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  26.23 
 
 
1025 aa  211  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
1112 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  30.33 
 
 
918 aa  209  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  30.14 
 
 
918 aa  209  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  28.95 
 
 
1178 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  30.02 
 
 
1414 aa  207  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  27.36 
 
 
773 aa  207  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  27.12 
 
 
985 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  27.36 
 
 
663 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  30.54 
 
 
1519 aa  205  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02255  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06600)  26.28 
 
 
1832 aa  204  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0976773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  29.61 
 
 
666 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  29.87 
 
 
914 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
1105 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  27.22 
 
 
872 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
933 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  29.83 
 
 
1088 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.24 
 
 
1848 aa  202  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.91 
 
 
959 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.66 
 
 
1102 aa  201  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  27.67 
 
 
1901 aa  201  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
1105 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  30.23 
 
 
1134 aa  200  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.77 
 
 
1080 aa  200  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  25.88 
 
 
1016 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  27.4 
 
 
924 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  25.85 
 
 
621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 
1028 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  29.07 
 
 
1082 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
1403 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  29.29 
 
 
918 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
1073 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.43 
 
 
1069 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  29.07 
 
 
1082 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
1073 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.81 
 
 
1069 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  28.88 
 
 
1082 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
925 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.29 
 
 
1113 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 
1113 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
1073 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
1073 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  27.18 
 
 
1386 aa  197  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  26.59 
 
 
1284 aa  197  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
1171 aa  196  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  29.35 
 
 
1070 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 
1155 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.89 
 
 
1091 aa  195  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>