More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47179 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  100 
 
 		 902 aa  1859    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  34.02 
 
 		 1193 aa  311  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  35.34 
 
 		 711 aa  303  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  33.12 
 
 		 1067 aa  302  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  29.22 
 
 		 898 aa  264  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 1082 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 1181 aa  250  7e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  32.58 
 
 		 589 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  31.96 
 
 		 509 aa  248  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  31.31 
 
 		 1077 aa  242  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  29.91 
 
 		 1901 aa  241  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  29.57 
 
 		 983 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 1069 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.61 
 
 		 1125 aa  238  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  32.36 
 
 		 959 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1071 aa  238  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  31.73 
 
 		 1096 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  30.55 
 
 		 1087 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 1112 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 		 1068 aa  234  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 918 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  31.38 
 
 		 1431 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  31.05 
 
 		 918 aa  231  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  31.05 
 
 		 918 aa  231  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  31.05 
 
 		 918 aa  231  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  30.74 
 
 		 918 aa  230  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  31.05 
 
 		 918 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  30.74 
 
 		 918 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  30.66 
 
 		 995 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  31.05 
 
 		 918 aa  229  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  31.05 
 
 		 918 aa  229  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  30.56 
 
 		 918 aa  229  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  31.96 
 
 		 1150 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  31.97 
 
 		 956 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  31.14 
 
 		 1259 aa  229  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 918 aa  228  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 1155 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 		 1021 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 1091 aa  227  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  29.89 
 
 		 1084 aa  227  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.76 
 
 		 1068 aa  227  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  29.71 
 
 		 1111 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  29.51 
 
 		 1084 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.2 
 
 		 1080 aa  224  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  29.34 
 
 		 545 aa  223  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.08 
 
 		 777 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.68 
 
 		 1407 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  31.43 
 
 		 1064 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.31 
 
 		 1250 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  31.54 
 
 		 1222 aa  222  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30.87 
 
 		 1086 aa  222  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  29.63 
 
 		 970 aa  221  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.47 
 
 		 1011 aa  221  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 876 aa  221  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  29.14 
 
 		 1394 aa  221  7e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1558 aa  221  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  28.91 
 
 		 821 aa  220  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  31.35 
 
 		 1068 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  31.23 
 
 		 1064 aa  219  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.4 
 
 		 1134 aa  219  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  31.24 
 
 		 1064 aa  219  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  29.22 
 
 		 1023 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.68 
 
 		 833 aa  218  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  29.92 
 
 		 1566 aa  218  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  30.86 
 
 		 1064 aa  218  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1088 aa  218  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  31.05 
 
 		 1064 aa  218  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  31.34 
 
 		 1848 aa  218  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1088 aa  217  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.91 
 
 		 1112 aa  217  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  28.66 
 
 		 1904 aa  217  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  30.86 
 
 		 1064 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  30.86 
 
 		 1064 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  30.86 
 
 		 1064 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 1068 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  30.86 
 
 		 1064 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 		 1055 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.42 
 
 		 977 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 1139 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 1068 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 982 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  29.96 
 
 		 663 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 1104 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.48 
 
 		 663 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.84 
 
 		 914 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 1120 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 1129 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 1112 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  31.09 
 
 		 1127 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 1261 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  28.27 
 
 		 821 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  31.12 
 
 		 1003 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.2 
 
 		 1067 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30.04 
 
 		 1130 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  29.53 
 
 		 522 aa  212  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  31.51 
 
 		 918 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.28 
 
 		 1062 aa  211  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 1108 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  30.83 
 
 		 860 aa  211  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  31.93 
 
 		 773 aa  211  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>