More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0368 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  100 
 
 		 674 aa  1374    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  36.04 
 
 		 621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  35.81 
 
 		 1181 aa  240  5e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 		 1055 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 1028 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 559 aa  232  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  34 
 
 		 1112 aa  227  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 		 1021 aa  227  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  35.91 
 
 		 985 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  33.12 
 
 		 1072 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 1164 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  34.32 
 
 		 1065 aa  223  9e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  33.76 
 
 		 1087 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  33.62 
 
 		 1071 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 1091 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.62 
 
 		 1068 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 1112 aa  220  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  33.13 
 
 		 1069 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  35.73 
 
 		 1002 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  32.84 
 
 		 1194 aa  219  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 1152 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.01 
 
 		 1067 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  35.31 
 
 		 1019 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.88 
 
 		 1034 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.12 
 
 		 1062 aa  218  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 1074 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.89 
 
 		 1102 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.96 
 
 		 1082 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 		 1069 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  31.92 
 
 		 891 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  33.7 
 
 		 1164 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 1050 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  34.27 
 
 		 959 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.51 
 
 		 1069 aa  213  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 1112 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  30.23 
 
 		 901 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  32.92 
 
 		 1130 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.12 
 
 		 1068 aa  213  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.26 
 
 		 1250 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  32.54 
 
 		 1032 aa  211  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.04 
 
 		 1031 aa  210  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  33.41 
 
 		 1159 aa  210  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.99 
 
 		 1084 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 950 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 		 1068 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 1082 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  31.45 
 
 		 1078 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 898 aa  209  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  33.48 
 
 		 1084 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 1068 aa  208  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.99 
 
 		 1084 aa  208  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  32.47 
 
 		 1040 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.53 
 
 		 1099 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 1118 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 		 1261 aa  207  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  32.15 
 
 		 1120 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  32.64 
 
 		 902 aa  207  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  33.76 
 
 		 1063 aa  206  8e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  32.06 
 
 		 1064 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.78 
 
 		 914 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  34.89 
 
 		 1394 aa  206  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 892 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  32.15 
 
 		 1120 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 1139 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  34.34 
 
 		 1178 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  31.84 
 
 		 1064 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.42 
 
 		 1110 aa  204  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  33.56 
 
 		 918 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  31.84 
 
 		 1064 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  35.08 
 
 		 1127 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  31.84 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  31.84 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  31.84 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  32.46 
 
 		 1048 aa  204  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  31.84 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 		 1068 aa  204  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 1066 aa  203  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  32.81 
 
 		 872 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  32.17 
 
 		 1142 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 1125 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  32.58 
 
 		 917 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  32.97 
 
 		 773 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 1033 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.26 
 
 		 1077 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  32.68 
 
 		 1006 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.39 
 
 		 1026 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.35 
 
 		 872 aa  201  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 1160 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  32.62 
 
 		 1086 aa  200  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 1129 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.82 
 
 		 663 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  32.54 
 
 		 1019 aa  200  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 982 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  31.65 
 
 		 899 aa  200  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  31.61 
 
 		 1064 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  34.29 
 
 		 896 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  32.77 
 
 		 1284 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 		 1066 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 		 895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 		 1171 aa  198  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>