More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4171 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  51.26 
 
 		 949 aa  937    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  44.6 
 
 		 975 aa  776    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  62.86 
 
 		 929 aa  1158    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  51.68 
 
 		 942 aa  949    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  44.95 
 
 		 951 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.85 
 
 		 961 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  65.77 
 
 		 932 aa  1219    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  64.61 
 
 		 960 aa  1200    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  48.5 
 
 		 966 aa  885    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  43.34 
 
 		 963 aa  764    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  52.1 
 
 		 665 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  41.99 
 
 		 961 aa  674    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  48.5 
 
 		 964 aa  853    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  46.65 
 
 		 963 aa  822    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  48.65 
 
 		 955 aa  845    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  48.4 
 
 		 967 aa  897    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 947 aa  1926    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  45.2 
 
 		 921 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  44.38 
 
 		 915 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  44.53 
 
 		 915 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  44.38 
 
 		 916 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  57.97 
 
 		 363 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.81 
 
 		 584 aa  211  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.14 
 
 		 572 aa  209  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.47 
 
 		 584 aa  206  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  28.79 
 
 		 560 aa  202  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.28 
 
 		 554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 1129 aa  194  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  27.53 
 
 		 467 aa  194  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.84 
 
 		 933 aa  192  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.96 
 
 		 835 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 1145 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1144 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 		 962 aa  184  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30.76 
 
 		 1147 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 1116 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.51 
 
 		 969 aa  182  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.4 
 
 		 966 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.95 
 
 		 988 aa  180  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28 
 
 		 1138 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.75 
 
 		 969 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 669 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.59 
 
 		 972 aa  174  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  28.17 
 
 		 578 aa  174  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.03 
 
 		 925 aa  170  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.12 
 
 		 1062 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.43 
 
 		 927 aa  164  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.45 
 
 		 805 aa  161  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.24 
 
 		 1095 aa  160  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  27.23 
 
 		 541 aa  160  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.15 
 
 		 801 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 877 aa  157  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 1046 aa  157  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.15 
 
 		 971 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.64 
 
 		 900 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1169 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.69 
 
 		 1170 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28 
 
 		 1169 aa  151  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 1137 aa  151  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  26.5 
 
 		 1201 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.76 
 
 		 1057 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 1201 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  26.86 
 
 		 1170 aa  150  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  26.24 
 
 		 1037 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 937 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 964 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  27.34 
 
 		 1160 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  26.1 
 
 		 1044 aa  144  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.12 
 
 		 1028 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 1167 aa  141  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.71 
 
 		 1170 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1136 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  25.57 
 
 		 1160 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.47 
 
 		 1168 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.59 
 
 		 1165 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.14 
 
 		 1038 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.05 
 
 		 1212 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.72 
 
 		 1049 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 		 1167 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1167 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.16 
 
 		 1170 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 1172 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.09 
 
 		 933 aa  137  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 1013 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  25.72 
 
 		 952 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.76 
 
 		 894 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  26.97 
 
 		 829 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  43.17 
 
 		 555 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 940 aa  130  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  39.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>