More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08850 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  100 
 
 
467 aa  954    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  46.64 
 
 
572 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  41.89 
 
 
560 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  42.11 
 
 
560 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  42.11 
 
 
560 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  42.11 
 
 
560 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  42.11 
 
 
560 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  42.11 
 
 
560 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 
560 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  42.11 
 
 
560 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  42.32 
 
 
560 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  42.05 
 
 
560 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  41.89 
 
 
560 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  45.94 
 
 
555 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  46.26 
 
 
554 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  41.04 
 
 
578 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  38.2 
 
 
584 aa  323  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  37.58 
 
 
584 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  36.02 
 
 
669 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  28.96 
 
 
915 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  28.78 
 
 
916 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  28.78 
 
 
915 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 
921 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  29.89 
 
 
951 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  32.42 
 
 
541 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
942 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  29.3 
 
 
949 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.51 
 
 
966 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.07 
 
 
961 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
947 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 
933 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
941 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.87 
 
 
969 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
941 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.4 
 
 
877 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  26.92 
 
 
963 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.41 
 
 
964 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.61 
 
 
988 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.7 
 
 
969 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.78 
 
 
929 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.72 
 
 
971 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.46 
 
 
1147 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.94 
 
 
801 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.65 
 
 
835 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  26.96 
 
 
1037 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  24.91 
 
 
1116 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
1002 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 
937 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
1172 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  27.94 
 
 
1043 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  26.43 
 
 
621 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.34 
 
 
872 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.15 
 
 
964 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  28.7 
 
 
1181 aa  150  6e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.26 
 
 
961 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.93 
 
 
1112 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.51 
 
 
919 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.52 
 
 
1072 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.7 
 
 
1031 aa  143  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.44 
 
 
894 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  26.13 
 
 
1069 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 
1069 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  25.23 
 
 
1046 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  26.22 
 
 
1142 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
1013 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  25.46 
 
 
777 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  26.35 
 
 
1096 aa  137  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  26.07 
 
 
1006 aa  137  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  27.07 
 
 
1023 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  25.92 
 
 
1250 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  47.97 
 
 
972 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  26.98 
 
 
1130 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
1152 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  26.49 
 
 
1326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  25.44 
 
 
995 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  26.83 
 
 
1437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 
1155 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  26.11 
 
 
970 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  26.16 
 
 
1284 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  24.32 
 
 
953 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  26.78 
 
 
891 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  26.83 
 
 
1164 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.57 
 
 
1091 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  26.67 
 
 
970 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
1164 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  26.98 
 
 
964 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  28.18 
 
 
773 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
967 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  24.08 
 
 
1062 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  25.35 
 
 
956 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  27.46 
 
 
1150 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  33.62 
 
 
932 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  25.17 
 
 
991 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  26.54 
 
 
1362 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  24.36 
 
 
968 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  25.8 
 
 
968 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  26.32 
 
 
1386 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  32.78 
 
 
665 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
955 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>