More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1345 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  46.79 
 
 
940 aa  659    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  48.93 
 
 
968 aa  822    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  48.92 
 
 
957 aa  814    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  100 
 
 
953 aa  1873    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  46.67 
 
 
946 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  45.2 
 
 
950 aa  699    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  46.01 
 
 
933 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  49.5 
 
 
986 aa  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  42.33 
 
 
958 aa  734    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  53.18 
 
 
969 aa  902    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  45.03 
 
 
949 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  44.23 
 
 
948 aa  683    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  41.88 
 
 
958 aa  727    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  45.01 
 
 
953 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  41.79 
 
 
941 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  43.37 
 
 
945 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  41.74 
 
 
923 aa  612  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
919 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  40.63 
 
 
933 aa  553  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.4 
 
 
949 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.66 
 
 
919 aa  329  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  31.04 
 
 
952 aa  326  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  53.61 
 
 
313 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.63 
 
 
1160 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  31.29 
 
 
1058 aa  191  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.98 
 
 
1046 aa  189  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  30.54 
 
 
1172 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 
1031 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.2 
 
 
1049 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29 
 
 
1045 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.59 
 
 
1169 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 
1169 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.31 
 
 
1160 aa  173  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.64 
 
 
1170 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.18 
 
 
1136 aa  172  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  25.86 
 
 
1177 aa  171  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.8 
 
 
1194 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.88 
 
 
960 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.98 
 
 
1172 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.07 
 
 
1170 aa  168  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.63 
 
 
1212 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
1129 aa  165  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.2 
 
 
1170 aa  163  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.87 
 
 
969 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.68 
 
 
971 aa  163  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.13 
 
 
1057 aa  162  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.21 
 
 
1167 aa  162  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.87 
 
 
937 aa  161  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.14 
 
 
829 aa  160  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  28.57 
 
 
1131 aa  160  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
1137 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.32 
 
 
1082 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1167 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.55 
 
 
954 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.17 
 
 
1147 aa  159  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  25.61 
 
 
877 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.25 
 
 
1201 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.25 
 
 
1201 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.34 
 
 
1062 aa  157  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.37 
 
 
1167 aa  157  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.91 
 
 
805 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 
962 aa  156  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  26.6 
 
 
982 aa  156  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.48 
 
 
952 aa  155  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.74 
 
 
900 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.48 
 
 
952 aa  155  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.11 
 
 
988 aa  155  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.4 
 
 
937 aa  155  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
952 aa  154  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  30.16 
 
 
1046 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
1145 aa  153  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.89 
 
 
941 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
1116 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.89 
 
 
941 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.22 
 
 
1168 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.39 
 
 
1170 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.4 
 
 
952 aa  151  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
964 aa  150  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  25.42 
 
 
801 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  26.88 
 
 
972 aa  150  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.99 
 
 
1165 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  29.32 
 
 
973 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.44 
 
 
1013 aa  144  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.17 
 
 
1028 aa  144  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.52 
 
 
966 aa  141  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  27.82 
 
 
925 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.13 
 
 
1138 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.15 
 
 
835 aa  137  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.15 
 
 
1144 aa  137  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  27.67 
 
 
969 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  24.32 
 
 
467 aa  134  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.55 
 
 
1095 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.18 
 
 
961 aa  127  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
933 aa  127  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.2 
 
 
555 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  30.19 
 
 
440 aa  122  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  35.91 
 
 
1094 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 
813 aa  122  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.5 
 
 
894 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.34 
 
 
572 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>