More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2075 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  49.39 
 
 		 1147 aa  748    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  66.46 
 
 		 1145 aa  1167    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  71.38 
 
 		 1138 aa  1241    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  99.51 
 
 		 1144 aa  1679    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 835 aa  1716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  42.03 
 
 		 1129 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  41.77 
 
 		 1116 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  34.77 
 
 		 1170 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  37.32 
 
 		 1160 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.16 
 
 		 1212 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.61 
 
 		 1172 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  32.64 
 
 		 1167 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  35.93 
 
 		 1160 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  36.09 
 
 		 1168 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  34.9 
 
 		 1170 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  35.45 
 
 		 1194 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  34.59 
 
 		 1169 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  35.55 
 
 		 1062 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  34 
 
 		 1170 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 1167 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  33.88 
 
 		 1170 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  34.85 
 
 		 1137 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  32.98 
 
 		 1167 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  34.02 
 
 		 1169 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  34.35 
 
 		 1172 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 1136 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  34.46 
 
 		 829 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 964 aa  347  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  33.5 
 
 		 1131 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.82 
 
 		 988 aa  316  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  31.15 
 
 		 969 aa  283  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 941 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 941 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.5 
 
 		 962 aa  267  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.43 
 
 		 971 aa  263  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.78 
 
 		 969 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.22 
 
 		 933 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.67 
 
 		 966 aa  250  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.65 
 
 		 925 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  37.75 
 
 		 440 aa  243  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  30.56 
 
 		 927 aa  240  9e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  32.36 
 
 		 922 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.09 
 
 		 972 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  33.28 
 
 		 877 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0392  hypothetical protein  72.92 
 
 		 185 aa  231  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.95 
 
 		 1069 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  31.95 
 
 		 1069 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.66 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  31.15 
 
 		 814 aa  223  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 937 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.67 
 
 		 894 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  31.92 
 
 		 805 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  32.29 
 
 		 801 aa  217  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.63 
 
 		 900 aa  207  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  31.61 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.83 
 
 		 919 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  30.39 
 
 		 560 aa  203  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  30.39 
 
 		 560 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  30.39 
 
 		 560 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  30.39 
 
 		 560 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  30.39 
 
 		 560 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  30.39 
 
 		 560 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  32.2 
 
 		 906 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  28.76 
 
 		 951 aa  202  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.39 
 
 		 1095 aa  201  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.25 
 
 		 555 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.39 
 
 		 952 aa  200  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  30.21 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  30.21 
 
 		 560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 		 560 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.97 
 
 		 1201 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 1201 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.33 
 
 		 1049 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  29.48 
 
 		 963 aa  195  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  34.88 
 
 		 760 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  29.83 
 
 		 560 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.21 
 
 		 1028 aa  194  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  29.39 
 
 		 949 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 		 963 aa  188  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 		 955 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.17 
 
 		 915 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.17 
 
 		 916 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 		 921 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.96 
 
 		 947 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  29.97 
 
 		 964 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 942 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  31.26 
 
 		 915 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.12 
 
 		 554 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.37 
 
 		 961 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  27.68 
 
 		 932 aa  183  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.68 
 
 		 1165 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 1013 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.29 
 
 		 1057 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  30.61 
 
 		 1044 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  27.48 
 
 		 929 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.45 
 
 		 1038 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.22 
 
 		 1058 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 1031 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 967 aa  179  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  27.23 
 
 		 966 aa  178  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>