More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4128 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.05 
 
 		 1212 aa  839    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  44.76 
 
 		 1160 aa  811    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  42.82 
 
 		 1170 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  43.99 
 
 		 1169 aa  816    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  62.35 
 
 		 1136 aa  1353    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  45.31 
 
 		 1170 aa  858    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  45.57 
 
 		 1172 aa  922    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  60.72 
 
 		 1137 aa  1321    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  45.07 
 
 		 1167 aa  831    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  46.1 
 
 		 1194 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  100 
 
 		 1131 aa  2239    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  64.72 
 
 		 829 aa  946    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  45.23 
 
 		 1167 aa  819    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  46.41 
 
 		 1167 aa  838    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  45.35 
 
 		 1168 aa  875    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  44.64 
 
 		 1170 aa  869    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  43.63 
 
 		 1172 aa  860    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  43.81 
 
 		 1169 aa  810    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  44.92 
 
 		 1170 aa  829    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  45.94 
 
 		 1160 aa  874    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  44.64 
 
 		 964 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  40.48 
 
 		 906 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  52.11 
 
 		 565 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  37.79 
 
 		 1116 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  36.97 
 
 		 1129 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  44.94 
 
 		 814 aa  452  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  40.13 
 
 		 774 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  38.85 
 
 		 760 aa  435  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.81 
 
 		 1145 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.42 
 
 		 1138 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  54.86 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1144 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.04 
 
 		 1147 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  33.79 
 
 		 835 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  32.55 
 
 		 1062 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  61.02 
 
 		 283 aa  306  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.53 
 
 		 988 aa  292  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  30.22 
 
 		 971 aa  287  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.35 
 
 		 969 aa  287  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  34 
 
 		 933 aa  275  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  54.9 
 
 		 312 aa  266  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  33.15 
 
 		 969 aa  258  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.38 
 
 		 941 aa  248  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.38 
 
 		 941 aa  248  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  33.03 
 
 		 966 aa  245  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  32.2 
 
 		 925 aa  244  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.89 
 
 		 801 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.78 
 
 		 805 aa  239  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 877 aa  239  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.28 
 
 		 962 aa  238  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 937 aa  233  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.01 
 
 		 972 aa  226  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  32.16 
 
 		 1069 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  32.16 
 
 		 1069 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.92 
 
 		 919 aa  212  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.17 
 
 		 894 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.02 
 
 		 952 aa  205  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 1046 aa  201  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  31.56 
 
 		 1057 aa  195  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 1031 aa  194  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.64 
 
 		 1045 aa  191  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  37.7 
 
 		 927 aa  189  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  37.38 
 
 		 922 aa  187  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  32.66 
 
 		 1044 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  32.3 
 
 		 1165 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.85 
 
 		 900 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.22 
 
 		 1049 aa  181  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  31.35 
 
 		 1082 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1058 aa  177  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  32.06 
 
 		 1038 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.15 
 
 		 560 aa  175  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  31.01 
 
 		 1095 aa  174  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.16 
 
 		 953 aa  172  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  28.4 
 
 		 1177 aa  167  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  29.62 
 
 		 968 aa  167  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  31.72 
 
 		 948 aa  167  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.45 
 
 		 1201 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 1201 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 669 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.38 
 
 		 554 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 		 923 aa  162  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  27.79 
 
 		 963 aa  162  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 955 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.81 
 
 		 555 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  27.57 
 
 		 975 aa  160  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  29.62 
 
 		 958 aa  160  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.59 
 
 		 1028 aa  159  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  31.02 
 
 		 950 aa  159  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 953 aa  158  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 945 aa  157  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  29.61 
 
 		 949 aa  157  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  36.86 
 
 		 346 aa  156  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  30.05 
 
 		 933 aa  154  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  30.4 
 
 		 946 aa  154  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.56 
 
 		 584 aa  152  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.09 
 
 		 1013 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.33 
 
 		 957 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 958 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.52 
 
 		 941 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  26.41 
 
 		 945 aa  149  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>