More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2198 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  84.66 
 
 		 1045 aa  1808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  39.88 
 
 		 1044 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  41.76 
 
 		 1038 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1046 aa  2136    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  40.76 
 
 		 1165 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  50.34 
 
 		 1049 aa  1009    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  37.81 
 
 		 1201 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  62.84 
 
 		 1058 aa  1316    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  85.1 
 
 		 1031 aa  1827    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  37.81 
 
 		 1201 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  41.94 
 
 		 1057 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  37.21 
 
 		 1095 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.46 
 
 		 1028 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  34.15 
 
 		 1082 aa  522  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 1177 aa  485  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  32.48 
 
 		 840 aa  344  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  32.01 
 
 		 724 aa  303  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  49.68 
 
 		 338 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  32.31 
 
 		 971 aa  248  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.46 
 
 		 969 aa  239  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 1169 aa  230  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.04 
 
 		 1169 aa  227  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.26 
 
 		 919 aa  225  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  31.75 
 
 		 1170 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 1170 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.11 
 
 		 933 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  33.4 
 
 		 1170 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.51 
 
 		 952 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.14 
 
 		 1116 aa  212  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.29 
 
 		 1212 aa  212  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.69 
 
 		 988 aa  211  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.58 
 
 		 966 aa  210  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.67 
 
 		 1160 aa  209  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.98 
 
 		 1194 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 1172 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 		 877 aa  206  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27.89 
 
 		 1129 aa  205  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1167 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 1167 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 		 1172 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1167 aa  201  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 1170 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.81 
 
 		 969 aa  196  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.96 
 
 		 801 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  26.91 
 
 		 957 aa  194  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 941 aa  194  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 941 aa  194  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.05 
 
 		 1160 aa  194  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.33 
 
 		 973 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  27.91 
 
 		 1136 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.05 
 
 		 805 aa  192  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.2 
 
 		 1147 aa  191  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.94 
 
 		 829 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  30.78 
 
 		 1137 aa  190  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.32 
 
 		 953 aa  189  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.24 
 
 		 962 aa  188  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.31 
 
 		 1062 aa  187  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.7 
 
 		 1168 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.12 
 
 		 945 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.05 
 
 		 937 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 954 aa  183  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.88 
 
 		 894 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 		 964 aa  178  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 956 aa  177  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  27.13 
 
 		 923 aa  177  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 		 900 aa  177  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 948 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 968 aa  175  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  29.92 
 
 		 953 aa  175  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.05 
 
 		 941 aa  174  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  28.13 
 
 		 969 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.67 
 
 		 949 aa  173  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.26 
 
 		 933 aa  172  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  28.85 
 
 		 952 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1046 aa  171  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 952 aa  170  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.69 
 
 		 972 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  27.19 
 
 		 958 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  25.55 
 
 		 982 aa  168  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  28.21 
 
 		 952 aa  168  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  28.21 
 
 		 952 aa  168  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26.31 
 
 		 958 aa  167  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  29.81 
 
 		 950 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  30.11 
 
 		 1094 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1144 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.77 
 
 		 835 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  24.32 
 
 		 937 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  29.76 
 
 		 927 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.2 
 
 		 1138 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 945 aa  162  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 		 1145 aa  162  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 986 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  26.94 
 
 		 946 aa  159  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.11 
 
 		 922 aa  158  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29 
 
 		 925 aa  157  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.02 
 
 		 960 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.84 
 
 		 949 aa  154  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 1013 aa  154  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  26.49 
 
 		 669 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>