More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1177 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  91.73 
 
 		 1045 aa  1926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  41.08 
 
 		 1038 aa  686    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1031 aa  2095    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  41.34 
 
 		 1057 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  40.98 
 
 		 1165 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  85.1 
 
 		 1046 aa  1827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  39.11 
 
 		 1201 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  61.32 
 
 		 1058 aa  1284    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  48.41 
 
 		 1049 aa  957    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  40.48 
 
 		 1044 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  39.11 
 
 		 1201 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  38 
 
 		 1095 aa  602  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.57 
 
 		 1028 aa  594  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  35.1 
 
 		 1082 aa  522  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 1177 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  34.24 
 
 		 840 aa  336  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 724 aa  300  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  51.78 
 
 		 338 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.1 
 
 		 971 aa  247  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  31.96 
 
 		 969 aa  242  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  33.21 
 
 		 1129 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.72 
 
 		 952 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.27 
 
 		 919 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.31 
 
 		 1116 aa  214  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  31.41 
 
 		 1170 aa  214  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1167 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 1167 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  31.7 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  31.17 
 
 		 1169 aa  212  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.49 
 
 		 1160 aa  211  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 		 1169 aa  211  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.18 
 
 		 1172 aa  211  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 1167 aa  208  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.74 
 
 		 988 aa  208  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 1170 aa  207  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.34 
 
 		 966 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 933 aa  207  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.22 
 
 		 801 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  32.22 
 
 		 1170 aa  205  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.28 
 
 		 1212 aa  205  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  31.84 
 
 		 1160 aa  204  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 		 877 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 		 1172 aa  201  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.16 
 
 		 973 aa  201  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.77 
 
 		 1194 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.71 
 
 		 805 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.81 
 
 		 969 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.01 
 
 		 1147 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  28.97 
 
 		 945 aa  197  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  32.04 
 
 		 1137 aa  195  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.12 
 
 		 941 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  31.32 
 
 		 962 aa  195  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.12 
 
 		 941 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.22 
 
 		 937 aa  194  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  30.21 
 
 		 1062 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  32.28 
 
 		 829 aa  189  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 		 954 aa  188  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1136 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.48 
 
 		 957 aa  186  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.89 
 
 		 1168 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.94 
 
 		 953 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 		 982 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.31 
 
 		 835 aa  178  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1144 aa  178  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 953 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  28.12 
 
 		 958 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.65 
 
 		 964 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  28.18 
 
 		 941 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.34 
 
 		 972 aa  175  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 		 952 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 968 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  30.49 
 
 		 1046 aa  174  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.81 
 
 		 952 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.81 
 
 		 952 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 958 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  28.08 
 
 		 933 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.97 
 
 		 952 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.46 
 
 		 900 aa  171  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.79 
 
 		 940 aa  170  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 948 aa  170  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  26.44 
 
 		 937 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  30.1 
 
 		 950 aa  168  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  29.04 
 
 		 956 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.98 
 
 		 1094 aa  167  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.7 
 
 		 923 aa  166  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27 
 
 		 1138 aa  166  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  30.46 
 
 		 894 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  29.79 
 
 		 927 aa  164  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 969 aa  161  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 945 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1145 aa  160  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  26.89 
 
 		 925 aa  159  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.17 
 
 		 960 aa  159  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 		 986 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  28.15 
 
 		 949 aa  159  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 919 aa  156  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 921 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  25.87 
 
 		 669 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.65 
 
 		 915 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.65 
 
 		 916 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>