More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5359 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  50.34 
 
 
1046 aa  1009    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  43.14 
 
 
1057 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  43.42 
 
 
1044 aa  747    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  100 
 
 
1049 aa  2134    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  43.19 
 
 
1165 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  48.94 
 
 
1045 aa  961    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  38.88 
 
 
1201 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
1031 aa  957    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  50.67 
 
 
1058 aa  1031    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  44.28 
 
 
1038 aa  750    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  38.88 
 
 
1201 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  38.31 
 
 
1095 aa  618  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.11 
 
 
1028 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  34.55 
 
 
1082 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  32.05 
 
 
1177 aa  465  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  32.16 
 
 
840 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  30.2 
 
 
724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  47.74 
 
 
338 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  31.47 
 
 
969 aa  240  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.12 
 
 
919 aa  239  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
954 aa  226  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  30.4 
 
 
952 aa  226  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.69 
 
 
988 aa  224  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
1170 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.72 
 
 
971 aa  220  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  30 
 
 
945 aa  219  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.45 
 
 
966 aa  217  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
1116 aa  217  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.65 
 
 
1172 aa  214  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
1169 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  33.46 
 
 
1170 aa  213  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  31.08 
 
 
1169 aa  210  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.39 
 
 
1170 aa  209  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.64 
 
 
1129 aa  208  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
933 aa  207  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.36 
 
 
962 aa  207  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.2 
 
 
1212 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  31.63 
 
 
1172 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.41 
 
 
969 aa  202  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  31.29 
 
 
1160 aa  201  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 
986 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  29.32 
 
 
957 aa  197  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 
1147 aa  197  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.33 
 
 
1144 aa  195  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.33 
 
 
835 aa  195  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.79 
 
 
1062 aa  194  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  29.19 
 
 
968 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  31.41 
 
 
964 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  30.49 
 
 
958 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  32.98 
 
 
1094 aa  193  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  30.83 
 
 
958 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.66 
 
 
972 aa  191  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 
1167 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
1167 aa  191  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
877 aa  190  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
948 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  29.79 
 
 
1167 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.5 
 
 
933 aa  189  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  30.16 
 
 
1170 aa  188  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  30.33 
 
 
950 aa  186  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 
941 aa  185  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.83 
 
 
949 aa  185  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 
941 aa  185  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.49 
 
 
1138 aa  184  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 
1145 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.53 
 
 
1160 aa  184  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.04 
 
 
1194 aa  184  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.2 
 
 
953 aa  183  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
1137 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  31.12 
 
 
1168 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  30.09 
 
 
969 aa  181  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.79 
 
 
829 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  28.41 
 
 
952 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  28.41 
 
 
952 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28.08 
 
 
952 aa  179  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 
1136 aa  179  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  28.54 
 
 
952 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29 
 
 
940 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 
900 aa  174  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  27.95 
 
 
937 aa  174  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.47 
 
 
960 aa  173  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
1046 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.63 
 
 
941 aa  171  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.39 
 
 
801 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.74 
 
 
805 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 
937 aa  168  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  29.64 
 
 
973 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  29.06 
 
 
982 aa  161  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 
919 aa  160  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
953 aa  159  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 
1013 aa  157  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  27.76 
 
 
946 aa  157  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.21 
 
 
964 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
923 aa  157  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.41 
 
 
949 aa  156  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.51 
 
 
933 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 
963 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.68 
 
 
894 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  30.44 
 
 
922 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  26.55 
 
 
584 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>