More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1236 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  46.85 
 
 		 953 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  47.92 
 
 		 949 aa  768    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  46.48 
 
 		 941 aa  717    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  41.35 
 
 		 958 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  54.68 
 
 		 933 aa  873    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  44.52 
 
 		 986 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  42.36 
 
 		 968 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 940 aa  1878    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  45.32 
 
 		 948 aa  707    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  49.95 
 
 		 946 aa  741    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  41.44 
 
 		 958 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  49 
 
 		 953 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  47.28 
 
 		 945 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  44.17 
 
 		 919 aa  647    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  42.72 
 
 		 933 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  40.88 
 
 		 969 aa  625  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  42.89 
 
 		 923 aa  625  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  41 
 
 		 957 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.17 
 
 		 949 aa  598  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  40.39 
 
 		 950 aa  571  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  36.15 
 
 		 919 aa  322  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  56.38 
 
 		 313 aa  279  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.41 
 
 		 952 aa  268  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.62 
 
 		 1160 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  32.27 
 
 		 1172 aa  194  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.67 
 
 		 969 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.99 
 
 		 1170 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32.43 
 
 		 1167 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.24 
 
 		 1045 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  32.03 
 
 		 1167 aa  187  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  30.65 
 
 		 1057 aa  187  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.54 
 
 		 1049 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 1058 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.18 
 
 		 1168 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 1167 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 1136 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  28.75 
 
 		 1194 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 954 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 1031 aa  181  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.74 
 
 		 1201 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 1170 aa  180  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 		 1172 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.74 
 
 		 1201 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.37 
 
 		 1160 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.01 
 
 		 1169 aa  179  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 1169 aa  179  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  30.14 
 
 		 1137 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1046 aa  177  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 964 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.95 
 
 		 971 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.55 
 
 		 829 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30.26 
 
 		 1147 aa  173  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.44 
 
 		 1038 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.41 
 
 		 1170 aa  171  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.64 
 
 		 941 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.64 
 
 		 941 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.95 
 
 		 1095 aa  168  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.27 
 
 		 1170 aa  168  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.48 
 
 		 937 aa  167  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.77 
 
 		 1062 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.39 
 
 		 1165 aa  164  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.65 
 
 		 1116 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.83 
 
 		 966 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.11 
 
 		 933 aa  164  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  28.08 
 
 		 945 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  26.26 
 
 		 1082 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 		 1013 aa  160  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.62 
 
 		 1129 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25.78 
 
 		 988 aa  157  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.74 
 
 		 969 aa  156  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.39 
 
 		 1028 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.52 
 
 		 900 aa  155  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.17 
 
 		 972 aa  155  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.71 
 
 		 952 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.71 
 
 		 952 aa  154  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.71 
 
 		 952 aa  154  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.6 
 
 		 961 aa  154  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.4 
 
 		 1145 aa  154  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  26.22 
 
 		 1177 aa  154  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  29.16 
 
 		 982 aa  154  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.75 
 
 		 960 aa  152  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.5 
 
 		 962 aa  152  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.2 
 
 		 805 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 956 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.35 
 
 		 952 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 937 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.89 
 
 		 801 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.26 
 
 		 973 aa  145  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 947 aa  140  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 578 aa  137  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  36.81 
 
 		 1131 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.65 
 
 		 1138 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  24.87 
 
 		 835 aa  135  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.24 
 
 		 929 aa  134  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1144 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.62 
 
 		 894 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  27.72 
 
 		 966 aa  132  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 921 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  29.5 
 
 		 1046 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>