More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4771 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  39.27 
 
 
958 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  61.9 
 
 
946 aa  1011    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.79 
 
 
949 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  48.55 
 
 
940 aa  707    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  45.32 
 
 
953 aa  686    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  48.69 
 
 
933 aa  725    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  45.03 
 
 
986 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  55.07 
 
 
941 aa  919    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  54.13 
 
 
945 aa  895    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  45.21 
 
 
949 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  44.08 
 
 
948 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  39.38 
 
 
958 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  100 
 
 
953 aa  1886    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  42.38 
 
 
968 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  40.38 
 
 
969 aa  595  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  41.92 
 
 
919 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
923 aa  578  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  39.17 
 
 
957 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  38.56 
 
 
950 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  38.36 
 
 
933 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.88 
 
 
952 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.62 
 
 
919 aa  283  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  54.9 
 
 
313 aa  270  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.55 
 
 
1160 aa  189  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 
1031 aa  186  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
1046 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.62 
 
 
1045 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.41 
 
 
1058 aa  179  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.17 
 
 
1170 aa  178  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.1 
 
 
1082 aa  178  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.34 
 
 
933 aa  169  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.67 
 
 
1095 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.95 
 
 
1049 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  31 
 
 
1136 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.46 
 
 
969 aa  160  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.66 
 
 
1028 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 
1172 aa  159  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.37 
 
 
966 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.04 
 
 
1168 aa  158  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
1147 aa  157  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 
964 aa  157  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
1137 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.53 
 
 
1038 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 
1170 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.85 
 
 
829 aa  155  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.88 
 
 
1057 aa  155  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.05 
 
 
1194 aa  155  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29 
 
 
1172 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.03 
 
 
1169 aa  153  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 
1169 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.79 
 
 
962 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.53 
 
 
1165 aa  153  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.46 
 
 
1170 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.91 
 
 
1129 aa  152  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.78 
 
 
1160 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  29.78 
 
 
1131 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.3 
 
 
1062 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  26.89 
 
 
937 aa  148  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.73 
 
 
960 aa  148  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 
1116 aa  148  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.94 
 
 
973 aa  147  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.91 
 
 
1201 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
1201 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
954 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  25.93 
 
 
1177 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  24.8 
 
 
988 aa  145  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.43 
 
 
1212 aa  144  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
1167 aa  142  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
941 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
941 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.99 
 
 
969 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.71 
 
 
1138 aa  140  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.29 
 
 
1170 aa  140  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
1167 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.38 
 
 
972 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.5 
 
 
1144 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  26.51 
 
 
945 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.5 
 
 
835 aa  138  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 
877 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 
1046 aa  138  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
1013 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 
956 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  24.91 
 
 
952 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  27.89 
 
 
1094 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  25.09 
 
 
952 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  25.09 
 
 
952 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 
1167 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 
1145 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  24.82 
 
 
952 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
982 aa  129  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.26 
 
 
805 aa  128  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  24.52 
 
 
971 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  25.16 
 
 
937 aa  124  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  25.67 
 
 
801 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  25.22 
 
 
467 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  26.83 
 
 
925 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.24 
 
 
584 aa  117  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 
900 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  27.71 
 
 
966 aa  115  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.29 
 
 
584 aa  115  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>