More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0725 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  100 
 
 
949 aa  1886    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  48.69 
 
 
946 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  52.6 
 
 
945 aa  840    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  51.47 
 
 
941 aa  841    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  47.88 
 
 
953 aa  716    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  41.23 
 
 
949 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  42.57 
 
 
940 aa  579  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  42.66 
 
 
933 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  41.03 
 
 
969 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  40.71 
 
 
948 aa  572  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  43.61 
 
 
953 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  40.91 
 
 
968 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  36.94 
 
 
958 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  37.14 
 
 
958 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  38.87 
 
 
957 aa  524  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  39.86 
 
 
986 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  37.24 
 
 
923 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  40.31 
 
 
950 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
919 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  36.65 
 
 
933 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34 
 
 
919 aa  260  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.4 
 
 
952 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  48.12 
 
 
313 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.95 
 
 
1057 aa  171  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.89 
 
 
1028 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.18 
 
 
1045 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 
1058 aa  168  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1046 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.15 
 
 
960 aa  164  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  28.7 
 
 
1049 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.3 
 
 
1095 aa  161  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 
933 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  30.96 
 
 
937 aa  158  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.35 
 
 
1031 aa  157  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1136 aa  157  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.48 
 
 
1160 aa  157  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.72 
 
 
829 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  27.89 
 
 
1160 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.83 
 
 
1201 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 
1201 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
1170 aa  151  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.56 
 
 
1172 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.66 
 
 
1172 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.59 
 
 
1038 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.62 
 
 
969 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.02 
 
 
1044 aa  147  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
941 aa  147  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
941 aa  147  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.39 
 
 
962 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.28 
 
 
1165 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 
1137 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.86 
 
 
1169 aa  144  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.71 
 
 
1167 aa  144  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.59 
 
 
945 aa  144  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  25.94 
 
 
1170 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
1167 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.54 
 
 
1082 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.93 
 
 
966 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
964 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 
1145 aa  141  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.3 
 
 
973 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.73 
 
 
1170 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.66 
 
 
1094 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.96 
 
 
1046 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.46 
 
 
937 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.37 
 
 
1168 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.14 
 
 
1169 aa  138  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  25.27 
 
 
801 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.26 
 
 
1212 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  25.73 
 
 
877 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.11 
 
 
1167 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25 
 
 
988 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.39 
 
 
1013 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  26.56 
 
 
1170 aa  134  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.21 
 
 
1147 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 
1177 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  25.19 
 
 
952 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  25.19 
 
 
952 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  25.19 
 
 
952 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.06 
 
 
972 aa  132  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.61 
 
 
954 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.67 
 
 
969 aa  132  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.75 
 
 
900 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  26.36 
 
 
1129 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  25.42 
 
 
805 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.23 
 
 
971 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  25.39 
 
 
982 aa  130  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  24.48 
 
 
952 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  26.52 
 
 
578 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.11 
 
 
1116 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.53 
 
 
1138 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.79 
 
 
894 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.78 
 
 
835 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.5 
 
 
1144 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
813 aa  119  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  26.1 
 
 
1062 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  25.98 
 
 
1046 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  25.73 
 
 
942 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  28.44 
 
 
440 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.25 
 
 
1194 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>